可是装备F-4D的两支中队情况则不一样，他们的地勤不仅是整个空军里最有经验的，而且他们的零部件都储存在自己的基地内。因此，这两支中队的地勤除了能够维护自己的飞机以外，他们还可以帮别的中队维护F-4E。然而，这些很快就随着战争的爆发而改变，71TFS和72TFS中队的F-4D被拆散成许多小型分遣队，派驻到伊朗南部的一些机场。
过了一段时间，三架遭到重创的F-4D被集中到梅赫拉巴德，这种型号的飞机自1970年初起就很难再见到了----在那里作为零配件供应机。虽然一些报道说这三架飞机再也没有飞行过，但是有信息指出其中一架(也许是两架)于战后经过大修并重新服役。1988年，在战争中遭击落坠毁的4架F-4D被集中到梅赫拉巴德，为其它的现役机体提供零配件。
1970年代末，一架挂载了AN/ALQ-87(V)3电子对抗吊舱的Blk51至56批次F-4E正从梅赫拉巴德基地起飞，由于敏感的原因，吊舱下方的天线被伊朗空军官方抹掉了。
战争中，伊朗空军的F-4经常从一座基地转移到另一座基地，比如，1981年春，TFB1基地的作战中队被派往瓦赫达提，前去支援在那里长期坚守的31TFS和33TFS中队。
尽管革命后伊朗空军鬼怪II的技术条件仍然不错，可是在经常性的骚乱、罢工、抗议、清洗和强制性退休的影响下很快就出现了问题。1979年3月至1980年4月间，有10架F-4由于低劣保养造成的技术故障而坠毁，16名机组身亡。
这样的问题在革命前就开始困扰伊朗空军了，1978年后期，整个空军基本上都停留在地面上，飞行训练几乎没有。但是从1979年中开始，当库尔德斯坦省和西阿塞拜疆省发生动荡后，一些中队开始重新返回现役，他们肯定卷入了自己国家激烈的内战中。然而，至1980年夏，整个空军的状况并没有得到显著改善。
同时，1980年6月，TFB3基地的空军军官发动了"诺杰政变"，试图推翻宗教政权----最后败露。接着是大规模的清洗，300名军官(主要是飞行员)被关进监狱，他们中的大多数被处决了。结果就是削弱了空军任务的有效性，限制了飞行员的训练和飞行时间。除去这些，伊朗的机组和鬼怪II在这场严格的考验中生存下来了，可是伊朗空军F-4作战单位的人事都发生了变化。
这架71TFW联队质朴的F-4E正从设拉子基地起飞。1980年两伊战争爆发后数周，71TFW联队就用F-4D取代了F-4E，而联队旗下的71TFS和72TFS中队在70年代中期就使用过F-4D。
其中的许多飞行员于1977年前加入伊朗空军，在美国或巴基斯坦受训，其中一些人甚至在美国和以色列空军中作为交换飞行员服役。更少的人暗中前往美国的秘密基地里参与米格机的试飞。结果就是这些优秀的机组可以把F-4的性能最大限度地发挥出来，即便是他们缺少实战经验也无妨。
然而，自1977年起，飞行员的训练质量发生了各种变化，他们起初受到的训练可以和被派到美国空军或者海军受训的机组相比，但是1978年中后期，由于伊朗的政治原因而开始降低。那些于1978年下半年受训的机组中，几乎没人完成整个训练课程。其中一些人员接受了神职人员的教导后被下放到作战单位里，他们不仅仅是飞行员，而且还是"政治委员"。
伊朗的F-4通常由两名飞行员驾驶，前座飞行员的军衔通常是上尉或者更高级别的。后座的军衔的较低，通常是中尉或者少尉，也是那些还未完成训练的菜鸟。同时在训练中，飞行员会根据课程的进程交换前后座的位置，使得初级军官获得更多的前座驾驶经验----，一旦战争爆发后，这样的现象经常会出现在作战单位里。一些情况下，机组会长期呆在一起，而在其它的情况下，老鸟会与菜鸟搭配。而这也是鬼怪机组认为"最糟糕的情节"，他们之所以能进入后座是因为他们对宗教政权的忠心要远高于他们在座舱里的能力。