巴基斯坦空军在1971年的空战中基本是防御性的，就像巴基斯坦空军最初希望在印度上空取得空中优势，但由于缺少战斗机而限制了对敌军部队发起空袭的数量。任何时候，只要可行的话都会去轰炸机场的跑道，以降低印度空军在绝对数量上的优势，但弹药的限制使得他们只能去扫射，剩下的AIM-9B用于自卫。
12月13日就对防卫严密的贾姆纳格尔(Jamnagar)空军基地展开了一次这样的空袭，31岁的默文.米德尔科特中校(驾驶F-104A 56-0773)带领着塔里克.哈比布(Tariq Habib)从低空向目标飞去，然后爬升到3000英尺高度准备扫射、米德尔科特最近几天对印度机场进行了3次侦察，在1965年完成了17个防空起落架次，到了1971年已成为了第9中队的中队长。进入扫射阵位要花几分钟的时间，使得印度人有更多的时间来组织防御。哈比布在扫射的时候发射了一枚导弹，但更险恶的威胁还在潜伏着，他们上方出现了2架米格-21FL。在星战斗机准备扫射的时候，海岸边的观察哨发出了警告，使得印度空军的飞行员有时间从贾姆纳格尔的作战待命停机坪上紧急起飞，同时在机场上方10000英尺高度处巡逻。
米德尔科特的座机挂载了2枚翼下响尾蛇和2个翼尖副油箱，冒着40mm高射炮的弹幕沿着主跑道狂奔，向后来印度空军声称的一堆假目标开火，并且离开了这片区域。一架印度空军第47中队“黑色弓箭手”的米格-21FL(77型)由巴拉特.索尼(Bharat Bushan Soni)上尉驾驶，他开着加力向那架星战斗机俯冲下去，并在100英尺高度处发射了一枚K-13(AA-2，仿AIM-9B)“环礁”红外格斗弹，但是错失了目标。
油画，1971年12月13日，巴拉特.索尼上尉驾驶米格-21FL C750号机用Gsh-23航炮击落F-104A 56-0773。
对于米德尔科特来说糟糕的是，这架米格机(编号C750)是位数不多的几架在机身下方的GP-9吊舱内安装有苏制Gsh-23双管航炮的米格-21FL。索尼在那架F-104后方900英尺出打了3个点射，而那架星战斗机开始燃烧。米德尔科特告诉哈比布他回不去了，然后就跳伞了。就在他的飞机倒过来坠入海里之际，米德尔科特的降落伞打开了，这一切都被哈比布目睹。一艘救援艇被派去搜索飞行员，但在满是鲨鱼的卡奇(Kutch)湾里什么也没发现。过了一会儿，哈比布发现自己的右侧有一架米格-21，然后试图机动到这架印度飞机的后方去攻击，但是发现自动稳定系统失灵后，他不得不逃跑脱离战斗。
米德尔科特之前在六日战争期间为约旦国王侯赛因服务过，而国王要求如果发现了他的遗骸，希望在埋葬的时候能够覆盖上约旦和巴基斯坦两国的国旗。
1971年12月13日，胜利返航后打开座舱盖的巴拉特.索尼上尉。
就像1965年一样，印度空军的堪培拉B(I).58在1971年的夜晚对巴基斯坦的空军基地产生了巨大的威胁。马斯罗尔作为F-104的驻扎地相当容易遭受轰炸，因此一支星战斗机战斗空中巡逻分遣队被派驻到附近的法伊萨尔(Faisal)空军基地，试图去逮住飞来的堪培拉。12月17日，就是在相同的一次战斗空中巡逻任务里，第9中队遭受了最后一例战损。拉希德.巴蒂少校和萨马德.钱戈子上尉分别驾驶从约旦借来的F-104A 56-0839和56-0767号机在印度边境附近巡逻，接下来他们得到命令，在从法伊萨尔到马斯罗尔的返航途中前往米尔布尔哈斯(Mirpur Khas)和纳雅楚(Naya Chor)周围徘徊。2架乌特莱基地的米格-21FL被发现正在保护4架HF-24风神支援地面部队，这6架印度飞机从10000英尺高度直接向F-104奔去。
米格-21飞行员们经常在低空执行猎杀任务，2架猎人或者风神作为诱饵来诱使巴基斯坦空军的截击机卷入战斗。然而，他们经常报告说巴基斯坦的空军基地没什么反应。这一次，两支双机编队都飞快地相向飞来，然后转到对手后方，钱戈子首先看见米格机，他脱离了巴蒂并转向米格机长机后方，接下来将其套入了航炮射程里。
印度空军第47中队的巴拉特.布山.索尼(Bharat Bushan Soni)上尉在1971年12月13日击落了默文.米德尔科特中校驾驶的F-104A 56-0773。
为了用翼尖副油箱来增加航程使得约旦皇家空军的F-104A无法使用响尾蛇导弹，这些飞机不像巴基斯坦空军的F-104A那样可以在主翼下挂载响尾蛇发射导轨。由于造成了额外的阻力，在战斗中一般不挂载副油箱。
第二架米格-21FL[由阿鲁纳.达塔(Aruna Datta)上尉驾驶]机动到钱戈子的后方并发射了一枚AA-2环礁格斗弹，但发射时的参数在有效范围外。过了一会儿，钱戈子无视巴蒂的命令，没有扔下副油箱并脱离，第二枚环礁钻进了56-0767号机里，飞机爆炸了，这名年轻的飞行员当场阵亡。米格机回到了边境处，而巴蒂此时油料也所剩无几，不得不返回马斯罗尔。在战争快要结束的时候，又有2架F-104A被米格-21FL的炮弹和导弹击伤，但这两架飞机都幸存下来。在战争剩下来的时间里，约旦皇家空军的F-104A被用于夜间防空，在翼尖挂载副油箱用于增加航程，而且只将航炮作为它们的武器。
印度空军第29中队“蝎子”阿鲁纳.达塔上尉在1971年12月12日驾驶一架米格-21FL用AA-2导弹击落了萨马德.钱戈子的F-104A 56-0767号机。
两场战争中，巴基斯坦空军弱小的星战斗机机群任务都相当的繁重，光是1971年12月就完成了104个起落架次。第9中队有限的空战机会显示他们给对手带来的威慑上是强有力的。在和米格-21期待已久的战斗中，环境每次都给它造成了阻碍。战争的时间更长些也许会给“狮鹫”中队更多的机会来平等地面对米格机，然而一些遭遇过米格机的飞行员说，这种苏制战斗机在低速下的机动性不会比F-104A好到哪里去。
美国持续在提供支援上做出限制，使得巴基斯坦空军的小规模F-104机群最终下降至不可使用的水平上，服役了12年之后退出了现役，总共累积了11690个飞行小时。至此，巴基斯坦空军原本采购的F-104A有6架在事故中损失，剩下的6架被用于静态展示。
约旦F-104机群的回归(减去56-0767号机，巴基斯坦用其提供更换)使得约旦皇家空军第9中队恢复了作战能力，直到1977年7月被诺斯罗普的F-5E/F取代。1972年11月18日，本身也是一名飞行员的约旦国王侯赛因告诉全球媒体，自己差点成为自己空军枪口下的牺牲品。一名叛军指挥官，据称是塔拉尔.卡提布(Talal al-Khatib)少校，他得到了来自巴勒斯坦和利比亚政变的灵感，在国王的美洲狮直升机即将起飞时驾驶F-104A来扫射。他的瞄准很差，而且他的座机很明显被其它的F-104A打下来了，卡提布死了，他是1968年被派到美国霍姆斯特德基地受训的一批约旦皇家空军飞行员之一。据说他的座机编号是56-0767，但是这个编号看起来像是在这种有争议的情况下用于掩盖事实，当然原本的56-0767号在1971年12月借给巴基斯坦空军的时候就被击落了。
尽管巴基斯坦的F-104起初被用于边境防卫拦截苏联轰炸机，但却有2次被用于完全不一样的用途，在1965和1971年的两场冲突中，巴基斯坦空军的星战斗机飞行员们经历了比任何F-104作战单位都要紧张的空战。在这些战斗里，他们面对着规模更加庞大的空军机群取得了一种空中优势，这就是洛克希德对其百系列战斗机的最初设想。