塞浦路斯
土耳其空军(Turk Hava Kuvvetleri：THK)在1963至66年间的美国军事防务互助计划中得到了一批46架崭新的洛克希德/加拿大航空造的F-104G和TF-104G，接下来又从北约盟国德国、比利时、西班牙、挪威、加拿大和荷兰手里得到了350架。之后在1974至76年间得到了最后一批40架阿里塔利亚/阿雷尼亚造的F-104S。2支中队----141和142 Filo中队以及一支作战换装中队在穆尔特德(Murted)基地使用F-104G，同时能够使用AIM-7麻雀中距弹的F-104S被划归给142 Filo中队以及第9 联队(Ana Jet Üs)在巴勒凯西尔(Balikesir)基地的中队。
1963年，随着希腊和土耳其于新独立的塞浦路斯岛上的敌对行为升温时，F-104G中队还在训练中，战斗轰炸机的任务因此交给了土耳其空军的F-84G雷电喷气和F-100C/D超佩刀。来之不易的和平接下去被维持了10年，但是格里克.桑普森(Greek Nicos Sampson)在1974年7月就任这个国家的总统又重新燃起了战火。土耳其向首都尼科西亚(Nicosia)投下了伞兵，而且从海上向这座岛发动了入侵。负责空袭的是3支中队的F-100和141 Filo中队的F-104G，它们轰炸了尼科西亚周围的目标，其中包括国民警卫队的兵营，巴勒凯西尔191 Flio中队的F-104G被调至穆尔特德，用于支援141 Filo中队以及7月21日发动的第二波两栖登陆，表面上是保护土耳其在塞浦路斯的公民。
随着战事愈演愈烈，和平谈判也被停止了，很多战斗在土耳其空军的星战斗机和希腊空军手里170多架同型号的战斗机之间展开----后者同样也从1961年开始在美国军事防务互助计划和北约的盟国空军中接收了一批新造的F-104G。然而，事情对于土耳其空军来说做了一个不一样的转向。希腊海军派出勒斯沃斯(HS Lesvos L-176)号登陆艇前往帕福斯(Paphos)，从而引发报告说一支希腊的船队正在集结中，准备反击土耳其的两栖登陆。格鲁曼的S-2E追踪者被派到天上去调查，而且他们的雷达报告看起来指出了一支潜在的敌军海上力量，但是一名土耳其空军RF-84雷闪侦察机的飞行员并没有发现支持这一说法的证据。然而，岸基雷达的搜索和之后S-2E的调查仍然显示了这一潜在的威胁，而且拦截到了希腊无线电通信指出3艘希腊海军的护卫舰正在试图与勒斯沃斯号汇合。
TF-104G 65-5911是德国空军转交给土耳其空军的36架双座星战斗机之一，由巴勒凯西尔基地的第9联队使用。在1974年和希腊爆发的塞浦路斯冲突期间，穆尔特德基地的F-104中队也被转移到巴勒凯西尔。照片摄于1991年的英国费尔福德。
一支攻击机编队由111 Filo中队的F-100D和141 Filo中队的F-104G组成，每架飞机上都挂在载了750磅的M117炸弹，当土耳其海军确认没有船只在目标区后于7月21日13:00下令展开攻击。16架F-104G在14:43从穆尔特德起飞，28架F-100D从埃斯基谢希尔(Eskisehir)和安塔利亚(Antalya)起飞，而191 Filo中队的F-104G和112 Filo中队的F-100C在待命警戒，为接下来的攻击做准备。在15:30，一条灾难性的消息传回来，这些战斗机轰炸的是土耳其海军的驱逐舰科塔塞佩号(Kotacepe D-354)、阿达特佩号(Adatepe D-353)、菲夫吉.卡兹马克元帅号(Maresal Fevzi Cazmak D-349)。被截获的希腊无线电通信是一个骗局(发自希腊驻塞浦路斯的海军指挥部)，将土耳其的舰只描述成希腊的，因为两支海军使用的驱逐舰看起来都一样(都是美制的基林级)。
在F-104G和F-100总共发起的不少于203个攻击架次中，所有3艘驱逐舰都遭到了轰炸，科塔塞佩号沉没，54名舰员身亡。191中队之后又派出了F-104G去侦察其它希腊入侵者的动向，但只发现了4艘没有威胁的小艇。191 Filo中队的一架F-104G坠毁(64-17783号机)，第二天早上确认了科塔塞佩号的沉没。当天晚些时候，141 Filo中队的17架F-104G用M117炸弹轰炸了尼科西亚机场(战争期间一个激烈的战场)，之后没过多久就停战了。美国对土耳其抢先发动攻击的干预就是向希腊空军第117联队提供F-4E鬼怪II，但是从8月14日起，土耳其空军的战斗机又进行了零星的攻击，第二天，停火协议被签署，在塞浦路斯岛上划了一条“阿提拉”线，把这座岛分成了2个地区。