在阿富汗，重型运输载具被用来疏散受损的直升机，运送伤员和死者尸体。此外还有特种型米-6运油机，在这些运油机的帮助下，其它型号的直升机可以前往难以到达的地点进行加油，扩大了作战半径。参加作战行动时，两架米-8或米-24同时从这样的一架运油机上进行“热”加油，意味着直升机上的发动机没有关闭。1983年，米-6开始为当地居民运送货物。阿富汗人参与了货物的装卸，这使得恐怖分子有可能实施一些破坏行动----忠于他们的人把手雷装进装食品袋里。米-6的机组人员还必须执行非常不寻常的任务。例如，1987年，他们向阿富汗运送了2000多名从巴基斯坦返回的普什图族难民。难民们聚集在坎大哈的一座特殊营地，从那里被米-6送到拉什卡尔加。他们把所有的家庭财物甚至柴火带上直升机，这些物件在沙漠中这是非常珍贵的。
瓦西里.伊万诺维奇.伊林(Vasily Ivanovich Ilyin/Василий Иванович Ильин)于1985年作为直升机副驾驶在阿富汗服役，期间完成了260个起落架次。
谢尔盖.瓦西里耶维奇.索洛德基(Sergey Vasilievich Solodky/Сергей Васильевич Солодкий)于1984至85年间作为直升机领航员在阿富汗服役，总共完成了200多次作战任务，飞行时间超过600小时，并获得3级祖国武装部队服务勋章。
米-6很少用于机降部队投送。很明显，司令部害怕这样一架直升机被击落后造成巨大损失，因为米-6的机组数量是米-8的2倍。然而，如果米-6参与了作战行动，那么它们就会编入第二波机群里，降落在已经占领的地点，比如，1982年在潘杰希尔战役期间就是这样。1985年在马扎里沙里夫地区，除了人员外，还运送了火炮、GAZ-66卡车和UAZ-469吉普车。米-6还参加了1982年在拉巴蒂贾利地区的机降行动，当时，机群误将伞兵带进伊朗领土。返航途中，“幽灵”们在里佐夫(Rhyzhov/Рыжов)少校的机组飞过“绿色地带”的时候击落了他们。机组设法紧急着陆，随即立刻布置了周界防御----“幽灵”们从四面八方涌上来。拯救的希望破灭了：从同一个着陆点返航的米-8一架接一架地经过，没有降落。然而，这一行为得到了简单的解释----小队中最后一架是搜救机，它带走了里佐夫的机组。遭遗弃的米-6于第二天被2架米-8摧毁。
米-6上安装的A-12.7机枪几乎毫无用处。 它的水平射界仅为±30°，直升机遭到的攻击主要来自后半球。 然而，领航员会借助机枪来确定风向，然后才降落在没有助降设备的站点上。子弹击中地面后会扬起一阵尘埃，如果地面上突然刮起一阵风，风就会带走了上升的尘埃，尘埃的运动方向可以帮助飞行员确定风向。在那些有机会使用Mi-6的“主要武器”的人中就有瓦列里.列昂捷夫(Valery Leontyev/Валерий Леонтьев)：在一场阿富汗“音乐会”之后，飞行员为了安全起见，让他开枪。
弗拉基米尔.安德烈耶维奇.奥梅尔丘克(Vladimir Andreevich Omelchuk/Владимир Андреевич Омельчук)于1987至88年间作为分遣队队长在阿富汗服役，总共246个起落架次，飞行时间278小时(其中240小时为夜间)，并获得2枚红星勋章。
米-6的坚固设计具有很强的抗打击能力，一架大型直升机飞得比较低，速度也比较慢，是一个诱人的目标。通常情况下，只有在着陆后才发现旋翼叶片和机里的自动武器弹头。大口径子弹的打击在飞行中根本不可能不被注意到。有一次，当一支机组从巴米扬返回喀布尔时，决定“割断钩子”，不再沿着峡谷，而是穿过高山冰川。他们爬到6000米，越过了看似最危险的路段，机组开始下降，而且已经在雾霾中看到了喀布尔，当时直升机从山坡上的村庄旁经过时，一挺DShK机枪开火了。机身侧面传来一阵鼓声，仿佛有人在用一把巨大的大锤敲打。这些打击留下的弹孔仍然令人印象深刻，但机组最终安全降落到阿富汗首都。然而，战争就是战争，损失是不可避免的，特别是敌人的防空系统逐年完善，圣战者的行动越来越大胆。1986年5月23日，塔拉萨.舍甫琴科(Tarasa Shevchenko/Тараса Шевченко)大尉的米-6直接在坎大哈机场上空被击落。这件事发生于整个团的晨间编队飞行中，没有人听到枪声或爆炸声。突然，5名机组从正在上升的直升机上跳伞，随后机身翻过来，砸在了空军基地附近。机上没有人死亡，但他们的不幸并没有就此结束----2个月后的7月12日，舍甫琴科的机组不得不再次从直升机上跳伞。
亚历山大.阿列克谢耶维奇.彼得连科(Alexander Alekseevich Petrenko)在1981至82年和1984至85年间作为米-6飞行员两次前往阿富汗，总共完成400多个起落架次，飞行时间超过1000小时，并获得了1枚红星勋章。
损失的高峰出现在1985年。首先，喀布尔地区的两架米-6于短短2周时间内被连续击落。随后，直升机在空中爆炸。当年夏天，圣战者拦截了同一支中队，后者当时正在运送大批当地的共青团活跃分子。飞到了巴哈拉附近，这架米-6穿梭在山间，突然被RPG火箭筒中。机身起火，舱室内一阵骚乱。副驾驶V.贝利亚科夫(Belyakov/Беляков)和领航员未经允许跳伞，希望能捡回一条命，却最终摔死----直升机差点坠毁，降落伞也来不及打开。飞行员保持冷静，成功地挽救了这架直升机。然而，伏击就是伏击，那些从燃烧的直升机里逃出来的人又被狙击手射杀。从巴哈拉及时赶到的运油机设法救走了一些人。
9月17日，另一架米-6在空中爆炸。这架直升机当时正从喀布尔飞往巴格拉姆，机舱内载有20多桶汽油。在M.格拉博(Grabo/Грабо)少校的机组中，只有副驾驶A.斯米尔诺夫(Smirnov/Смирнову)奇迹般地从燃烧着的、摇摇欲坠的直升机上逃脱(这件事发生后，飞行员被戏称为“非法居住”)。1985年的麻烦并没有就此结束。不久，普勒胡姆里机场发生了一场悲剧。一名迷航的阿富汗飞行员试图将他的苏-22降落在350米长的跑道上。昆都士中队指挥官尼古拉.拉普欣(Nikolay Lapshin/Николай Лапшин)少校说，当时，一架米-6正滑行到起跑点，那个阿富汗人以极快的速度撞上这一架直升机，两架飞机都爆炸了，现场没有任何人生还。米-6也遭到来肩扛式地空导弹的威胁。1984年10月14日，一枚SA-7导弹在喀布尔上空击中一架米-6。
普勒胡姆里机场上的米-6，远处的萨朗山口依稀可见。
1987年，一架米-6运油机在坎大哈地区飞行。
