在大马士革外围的大型机场梅泽(al-Mezze)也同时遭到了4架神秘的轰炸，但是由于途经黎巴嫩和赫尔墨山，以军的编队失去了奇袭的意义，结果遭到了2架米格-17的拦截，以军编队4号机(109中队的纳坦.佐雷尔上尉)被祖海尔.鲍瓦布(Zuhair al-Baowab)上尉发射的炮弹击中，最后在黎巴嫩上空跳伞，鲍瓦布在消耗战争期间继续驾驶米格-21。10分中后，2架崭新的米格-21PF在特塞卡尔(Tsaikal)空军基地上遭遇了4架以色列空军105中队的超神秘B.2，结果双双被击落[其实遭遇的是119中队的幻影III，获得战机的分别是阿舍尔.斯尼尔(座机天火32)和吉奥拉.罗姆(座机天火43)，因为当天105中队的超神秘B.2没有空战战果记载]。多亏了伊拉克在1966年送来了一架米格-21F-13，以色列空军知到如何进行机动来对付米格机，经验丰富的叙利亚空军‘M’(为了个人安全不公布姓名)上校(已经退役)回忆道：
“在这场战争中我们学到了----那个错误的方法----尤其是在低空，R-3环礁导弹的发射范围实在太糟糕，我们针对猛烈机动的以色列战斗机几乎没有办法。”
在霍姆斯(Homs)空军基地，叙利亚空军遭受了一场浩劫，他们眼睁睁地看着以色列飞机轰炸跑道。像其它的叙利亚机场一样，这里有至少10架木质的米格-17和米格-21假目标。但以色列飞行员看起来对假目标分得很清楚，攻击过后，霍姆斯的人员查看了机场，只有真的米格机才被击中了，那些假目标根本没被碰过，结果导致叙利亚空军内部传闻说在高层出现了叛徒，在塞卡尔和马尔吉.鲁哈伊尔(Marj Ruhayyil)空军基地的情况也是一样的。
对于叙利亚空军来说，六日战争在几乎在开始前就已经结束了，而且在6月5日，以色列空军声称说摧毁了叙利亚空军36架米格-21中的30架，其中包括2架在空战中被击落，剩下来的6架飞机和幸存的米格-17一起飞往叙利亚最北边的机场。在战争剩下的时间里，叙利亚空军只进行了数量有限的空中巡逻，试着将仅剩的空中力量保存下来。戈兰高地上的叙利亚部队也遭到了以军的猛击，尽管抵抗英勇却回天乏术。
伊拉克的支持
这场战争同样也让伊拉克人措手不及，如果战争爆发了，他们计划向叙利亚派出几支战斗机中队，但是在以色列攻击的时候，伊拉克人的准备还没有结束。由于叙利亚空军被打残，机场受损严重，这个计划又被取消了，可伊拉克空军的猎人还是攻击了以色列境内的目标。6月5日上午，他们和以色列的幻影III展开了2场空战，然而，在伊拉克空军发现到底发生了什么之前，埃及、约旦、叙利亚已经被打垮了。
一架前伊拉克空军的米格-19S换成了阿拉伯联合共和国空军的涂装并且正在减速中，此照片拍摄于1965年7月20日或8月11日。
中午，4架以色列空军110中队的秃鹰对伊拉克展开了第一波空袭，轰炸了H-3瓦利德(Walid)基地，在巡逻的米格-21做出反应之前就已经离开了。尽管无线电出现了问题，可以色列空军宣称在地面上炸毁了6架米格-21和6架其它飞机。所有剩下的伊拉克战机受命返回伊拉克中部的哈巴尼耶。但在他们完成调动之前，以色列空军又向H-3基地发动了第2波空袭。以军编队出现的时候正值2架米格-21将要起飞，去接替天上正在执行巡逻任务的霍克猎人。结果是短暂而又激烈的空战，将以色列人的攻击减弱，为各自为战。战果也是微小的，他们错过了一些图-16，击伤了一架猎人，并击落了2架负责保卫的米格-21。
这次激战之后，伊拉克空军最高指挥部决定甚至不在H-3基地加油，所有的巡逻队都将降落在哈巴尼耶。由于航程很短，伊拉克的米格-21已经有效地远离了战斗。保卫H-3基地的责任交给了猎人。6月7日，他们在以军第3次空袭这里时击落了一架幻影III和一架秃鹰(天火60和秃鹰14)，相反也被击落了2架猎人(吉登.德罗尔驾驶的天火60和本.锡安.佐哈尔驾驶的秃鹰17)。剩下幻影III和秃鹰(分别来自以色列空军107和110中队)惊魂未定，在回来的路上又遭遇了2架叙利亚的米格-21PF，以色列战机在高空笔直地飞行，使得这些米格机飞行员很难发射R-3导弹。但是，尽管所处的位置不佳，4枚环礁导弹还是被打出去了，4枚中有3枚都被打飞，而最后一枚在一架幻影III近处爆炸并将其击伤，可还是阻止不了那名以色列飞行员安全地降落。
在8日晚上，以色列人做出了一些尝试，试图救回在H-3基地上空被击落的机组(幻影III飞行员吉登.德罗尔和秃鹰飞行员伊扎克.戈兰)。他们派出了一架N2501诺斯特拉斯运输机，但是遭到了一架叙利亚米格-21PF的拦截。然而，这名未知姓名的叙利亚飞行员发射的2枚环礁导弹都打偏了。此次任务标志着以色列空军对H-3基地空袭的结束，也宣告了叙利亚和伊拉克空军的米格-19及米格-21在六日战争作战的终结。
埃及、叙利亚米格-21飞行员在六日战争之前和期间与以色列人的冲突中并没有占到什么便宜，甚至连以色列的暴风都能玩转并击落米格-21。但是想到埃及和叙利亚飞行员没有接受过空中格斗的训练，他们在空战中的表现还是可以的。然而，由于大量的阿拉伯飞行员阵亡或因为政治原因被踢出去，阿拉伯国家的空军失去了宝贵的延续性和经验。