然而，百舌鸟也有它的缺点。在使用上，它需要安装专门的引导头，在发射前针对敌方的雷达选用波段在其引导头狭小范围内的导弹，一旦起飞了之后就无法更换引导头。百舌鸟的射程也很短，从铁掌机上发射后飞行的时间比SA-2导弹还短。就像一句名言所说的，用百舌鸟来打地空导弹就像是"用烤肉叉去叉一条响尾蛇一样"。这种导弹的战斗部也不是很大，而且不久就让北越的地空导弹操作员(他们现在是世界上最专业的)知道搞定这种导弹的最好办法就是把雷达关掉。然而，百舌鸟所能做的就是压制雷达站，给暴露在地空导弹和高射炮下的攻击机创造逃跑的时间和空间。
然而，标准反辐射导弹则是完全不同的另一种武器，这也是海军研发的。这种导弹给予A-6B更远的发射距离，使其能够呆在SA-2导弹的射程范围之外。这种导弹引导头所覆盖的波段范围也更加广泛，而且可以在发射前设定专门的目标----一些事情百舌鸟是没法做到的。它的价格也很贵，而且机组被指示等待确保到"高命中率"的时候才能发射。这种导弹在整个越战期间都随A-6B一起服役，还有空军更为人们所熟知的F-105G野鼬鼠。
在起初预想组建3支装备12架A-6B来专门执行这种任务的中队后(和空军做的差不多)，美国海军认为他们还买不起这样的奢侈品，于是就朝现有的机群开刀。装备A-6B的中队只有一小部分机组成员接受过在这种系统上的专业训练并精通其使用，其中一些轰炸领航员得知道系统中用来分析电子环境的电子"蜂鸣和尖叫器"是如何工作的。
1966年6月西海岸的A-6换装训练中队成立，照片中间是卡罗尔.考克斯(Carol Cox)女士，他被称为“黄金入侵者小姐”。这些飞行员是第一批教官，都来自于惠德贝岛的A-3换装训练中队，照片从左至右分别是查理.亨特少校(后来获得海军十字勋章)、‘Buzz’埃德斯莫(Edismoe)少校(1968年1月26日阵亡)、休.布莱纳德(Hugh Brainard)上尉、吉姆.维斯特(Jim Vester)上尉、约翰.昂德伍德(John Underwood)中校(VAH-123中队长)、约翰史密斯上尉、弗雷德.霍尔梅斯上尉(1968年12月30日失踪)、唐.科特尔(Don Cotter)上尉、罗布.艾克纳(Rob Eichner)上尉、卡尔.维赫尔特(Carl Wiechert)上尉。其他不在照片里的教官还有莱尔.布尔上尉和唐.金少校。背景上是A-6A 151582，改装成KA-6D后，于1979年2月22日服役于VA-85中队时因事故坠毁，机上2人身亡。
A-6B为美国海军带来了尖端的反雷达能力，并且最终导致在数量有限的A-6E上安装AWG-21系统，直到80年代中期EA-6B徘徊者和AGM-88哈姆反辐射导弹服役前都不会有很大的改变。
随着企业号和游骑兵号北上前往朝鲜海域转圈，VA-75中队成为了TF77特混舰队里唯一的一支入侵者中队。2月24日，中队的杰瑞.扎查里亚斯和轰炸领航员麦克.哈尔(Mike Hall)少校驾机在夜间起飞，从低空轰炸了河内东南出红河上的一个港口。他们成功地躲避了大量的防空火力并精确地投下了24枚炸弹，之后在低空尽可能低地以超过500节速度从河内市区上空飞过，他们都因此而获得海军十字勋章，也是第二支获得此项殊荣的A-6机组。
企业号在1968年2月22日返回战场，同样还有上面CVW-9联队里的VA-35中队----后者装备了11架A-6A和3架A-6B，中队长是格伦.科尔曼(Glenn Kollman)中校。"黑豹"的抵达也开始了入侵者中队的第10次越战部署，其中有2支来自大西洋舰队的欧塞纳海军航空站。
就是在热身练习中，VA-35中队成为了航母上第一支试射AIM-9红外格斗弹的A-6中队，入侵者一共可以携带4枚这种导弹。在越南，A-6挂载这种导弹的用处极为有限，因为绝大多数中队都想留着这些挂点用来挂载副油箱或者炸弹，借助着黑夜的掩护在低空飞行，而将敌机挡开是鬼怪II的职责。
在早期的开始阶段，"黑豹"中队因为北朝鲜在1月23日挑起的普韦布洛号事件而随企业号离开扬基站北上。随着林登约翰逊政府选择通过政治途径而不是军事途径来解决这场冲突，企业号又撤回南边在2月22日回到战斗中。
2月24日，中队长科尔曼和轰炸领航员约翰.格里菲斯(John Griffith)上尉驾机在夜间轰炸了一个货物集散地，并且面对着猛烈的防空火力给目标予重创。很快，在3月12日，他们驾驶A-6A 152943从航母上起飞后不久便撞海坠机身亡。两人都在之后因为24日晚上那一次轰炸行动而被追授海军十字勋章，成为第3支获此荣誉的A-6机组。
1967年，VA-165中队随游骑兵号上的CVW-2联队开始了第一次越战部署，中队的队徽只是一个简单的绿色箭头。照片中的A-6A 152906后来被改造成KA-6D，1994年退役。
约翰.格里菲斯来自密苏里州的堪萨斯，他在1960年成为一名海军航空观察员，并且在佛罗里达州山福德的VAH-1中队作为一名A3D-2的轰炸领航员服役，之后才换装驾驶A-6。在他死的时候，格里菲斯也许是获得荣誉最多的海军飞行军官，有海军十字勋章和银星勋章各一枚、5枚优异飞行十字勋章、两枚个人飞行勋章、9枚攻击/飞行勋章和一枚加带有作战"V"字的海军奖章。
"黑豹"中队的第一次战损出现在2月28日夜，亨利.孔斯(Henry Coons)少校和汤姆.斯蒂格曼(Tom Stegman)上尉驾驶A-6A 152938(NG 512)沿着北越海岸攻击目标时坠毁，飞机的一小部分残骸，包括被高射炮弹打烂的尾部均被找到，但两名机组成员却再也没有被找到过。两天之后的一个晚上，VA-35中队又损失了一架飞机(A-6A 152944(NG540)，随一支三机编队轰炸锦普时坠毁，汤姆.谢乌里希(Tom Scheurich)少校和理查德.兰诺姆(Richard Lannom)上尉没有跳伞，这架飞机既可能是被击落的也可能是在飞行中撞地坠毁的。
在整个3月初，恶劣的天气一直影响着滚雷行动，这意味着企业号上的A-4和F-4中队所做的事情十分有限。然而，CVW-9联队里的入侵者中队却和平常一样工作。在3月16日夜，VA-35中队派出了一支编队前去从低空轰炸河内以北的Khe Nu铁路货运站。其中一架入侵者(A-6A 152940(NG510))在距离地面200英寸高度高速飞行时被高射炮击落，飞行员爱德华.舒曼(Edward Shuman)少校和轰炸领航员戴尔.多斯(Dale Doss)跳伞后被俘。
5月13日，布鲁斯.布雷姆纳(Bruce B Bremner)上尉和杰克.法尔迪(Jack Fardy)上尉驾驶A-6A 152951(NG510)在夜间轰炸荣市机场时被一枚57mm高射炮弹击中右主翼，扔下了挂载的Mk36地雷后飞机起火了，布雷姆纳驾驶飞机向海上飞去并且开始大角度爬升，希望借助高空稀薄的氧气来把火灭掉。然而，就在他们试着返回航母的时候事情变得更加糟糕，一个爆炸之后飞机解体了，两人均成功跳伞并被一架HC-1中队的搜救直升机接走。
布雷姆纳把他自己称之为"B³"，他将完成这次巡航，最终在入侵者上获得超过5000小时的飞行经验，先后担任VA-85中队长、CVW-17联队长、萨万纳号(USS Savannah ARO-4)舰长、珊瑚海号舰长，并且在海军太平洋舰队和大西洋舰队的A-6中队里都飞过，他最后以少将军衔退休。还需要注意的是他曾经在驾驶A-6时2次跳伞(还有一次是在1971年4月19日于海军航空测试中心附近)，而且有一次在轰炸领航员跳伞后独自驾机降落。
1967至68年越战部署期间的游骑兵号甲板，右下角的摄像师正在记录下飞机降落的每一个过程，照片中还能看到VA-147中队的A-7A和VA-22中队的A-4C。
