伊拉克空军更具挑衅性的行为差一点让美国海军的雄猫在1999年1月5日获得了第一个不死鸟导弹的战果，两架VF-213中队的F-14D向闯入禁飞区里的米格-25发射了2枚AIM-54C，而此时伊拉克飞机已经调头向北高速飞去，远远发射的导弹什么也没有打中。
伊拉克对南部守望行动的公然蔑视意味着在“盒子”里巡逻的联军飞机几乎每天都会主动被火控雷达锁定，而且还有乱飞的高射炮弹和盲射的地空导弹出现。在沙漠之狐行动之后，这样的违反决议的行为导致西南亚联合特遣队展开了迅速却有所斟酌的反击。通常，相关的任务----被称之为应对措施(RO)----在联合空中作战中心批准的预先打击行动框架内被确定。应对措施允许执行任务的飞机对威胁或入侵做出回应，或者以协调的方式向已经得知位置的地空导弹/高射炮和指挥管制点发动空袭。
2003年3月，这架VF-2中队的F-14D上挂载了2种主要的防空武器。大约在4年前的1999年9月9日，“赏金猎人”中队的F-14D和AIM-54C组合差一点就给美国海军带来了不死鸟导弹的第一个战果，VFA-151中队的大黄蜂飞行员罗恩.坎迪洛罗(Ron Candiloro)少校(他后来随该中队参与了自由伊拉克行动)回忆道：
“这次事件是我整个服役生涯中最令人兴奋的，因为有2架伊拉克米格-23从塔卡杜姆起飞进入了南部禁飞区，我们决定去拦截。我当时是那架朝伊拉克人发射不死鸟导弹的那架F-14D的僚机。这枚导弹最终撞向了地面，而我则发射了一枚麻雀。米格机发现不死鸟导弹脱离挂架后就调头逃跑，那支雄猫机组在另一个无线电频道上，我也没有听见他们发射导弹的呼叫，我只是看见了那枚导弹突然间飞出去了！”
F-14D机组在经过安全频道的无线电通信并从Link16数据链（联合战术信息分布式系统）上获得信息后可以发射AIM-54C。但坎迪洛罗少校的座机没有安装这种系统，他不知道为什么他的雄猫转向北边加速，他同样也不知道这支F-14机组已经获得了开火的许可，直到这枚不死鸟脱离了挂架。如果伊拉克战机没有转向北面，那么它们肯定就被这枚导弹击落了。在整个南部守望行动期间，F-14经常挂载AIM-54C，而且在自由伊拉克行动开始后最初几天时间里的防御性空中反击任务里也挂载了它。然而，当伊拉克空军不再被视为一种威胁后，这种导弹也从挂架上消失了。确实，F-14机组在绝大多数时候只挂载了2枚AIM-9M用于自卫。
1999年9月9日，在一次对巡逻行动的明显阻挠之后，星座号(USS Constellation CV-64)上的CVW-2联队发起了炮烟行动，在接下来的一系列精确轰炸行动中，“盒子”里39个高射炮/地空导弹阵地中的29个都被摧毁了。这是自沙漠风暴行动以来单天投弹量最大的空袭。VF-2中队的F-14D在这次行动中起到了领导作用，除了投放激光制导并引导F/A-18发射AGM-65E以外，他们还远远地向一架伊拉克米格-23发射了一枚AIM-54C，但是同样没有击中。
在1999年的前面9个月里，美军和英军的飞机完成了10000多个南部守望起落架次，向400多个目标扔下了1000多枚炸弹。这种级别的飞行一直持续到新千年，而且在2000年3月至2001年3月间，联军飞机在伊拉克境内完成了10000多个飞行架次，期间遭到了不少于500次地空导弹和高射炮的攻击。联军的飞机自2001年1月1日起遭到了60余次攻击，作为对这种行为的回应，美军和英军的飞机在38次巡逻任务中向伊拉克目标扔下了炸弹。
期间最大的一次打击行动(自炮烟行动之后)于2001年2月16日展开，哈里.杜鲁门(USS Harry S Truman CVN-75)上的CVW-3联队轰炸了5个3C站点，在这为期一天的行动中，打头阵的又是VF-32中队，投放激光制导炸弹，引导大黄蜂投弹，执行TARPS侦察任务，在“盒子”里进行防卫性战斗空中巡逻。
尽管这里的冲突的不断升级，但是2001年9月11日五角大楼和纽约世贸大楼遭袭给这一地区带来了短暂的和平。接下来小布什总统向恐怖分子宣战，第5舰队控制下整个执行南部守望任务的航母战斗群都向东转移至阿拉伯海，支援阿富汗境内的持久自由行动。随着大量的作战飞机在内陆国家阿富汗上空长期执行远程任务，美国海军在南部守望行动中的飞行停止了，这使得伊拉克人能够把更多的防空力量部署到33°线以南。
到了2002年春，阿富汗的塔利班政权被推翻，美国政府又再次将焦点转移到萨达姆.侯赛因这个老冤家身上。证据就是在2002年8月末，乔治.华盛顿号(USS George Washington CVN-73)及其搭载的CVW-17联队进驻北阿拉伯湾，这是近一年之后第一艘参与南部守望行动的航母。抵达后没多久，整个联队(包括VF-103中队)在巡逻过程中不断遭到高射炮和地空导弹雷达的拦截，接着开始了应对措施的还击。
一支VF-2中队的机组正准备走进这架挂载了GBU-16的F-14D 164351的座舱里，参与1999年9月9日的炮烟行动。在这次为期24小时的南部守望攻势中，小鹰号上的CVW-2联队经历了自沙漠风暴行动以来消耗弹药最多的一天，VF-2中队带头冲锋，整个联队摧毁了39个指派目标中的35个----57mm S-60和100mm KS-19高射炮及地空导弹阵地----在巴士拉周围。参与了自由伊拉克行动的拉瑞.伯特(Larry Burt)上尉当时是CVW-2联队VFA-137中队的中队长，他回忆道：
“VF-2中队将使用自己的激光制导炸弹去轰阿瓦炸高射炮阵地，而且为大黄蜂的激光幼畜照射目标。F-14机组将去寻找另一门高射炮，呼叫大黄蜂、进入、并用蓝丁吊舱照射目标。这样的组合被证明是致命的，一支F-14机组在一次任务里就炸掉了10门高射炮----4门被激光制导炸弹炸掉，另外6门用激光幼畜消灭。”
应对措施的主要目的是为了强制执行南部守望行动，以达到联军应有的使命，以此保证巡逻的飞机能够顺利的在伊拉克禁飞区上空飞行。起初，对防空力量进行当即轰炸是之前的标准，而在沙漠之狐行动被延迟取消后，当禁飞区出现反抗的举动时则会采取惩罚性打击的措施。911事件后的应对措施更加激进，联军采取的政策就是攻击任何进入禁飞区的伊拉克部队，它甚至可以不用将回应放在首位。这样一来，在南部守望行动最后几个月时间以及为自由伊拉克行动准备战场期间采取的都是这样预先制定好的应对措施。
已经在阿富汗参与了数个月的持久自由行动，CVW-17联队此次部署的最后三周时间是在北阿拉伯湾上度过的。接下来，乔治.华盛顿号返回地中海，交给第6舰队，然而在12月返回美国。此时在北阿拉伯湾上游弋的是亚伯拉罕.林肯号(USS Abraham CVN-72)，开始了他们长达10个半月马拉松般的作战部署的初期阶段。像华盛顿号一样，这艘航母在2002年10月末开往北阿拉伯湾前一直在支援持久自由行动，但是其所搭载的CVW-14联队并没有在阿富汗上空漫长的巡逻中参与战斗。
但这一切都在参与了南部守望行动之后改变了，这要感谢布什政府因为所谓的大规模杀伤性武器问题而将焦点转移到和伊拉克开战上，萨达姆.侯赛因和本.拉登基地组织的关系也被大肆渲染，这场争论在2002年9月结束，美国国防部长唐纳德.拉姆斯菲尔德做出的决定就是提高美英战绩在执行南方守望行动的任务强度，以面对伊拉克方面不断增长的威胁，全面战争是不可避免的。