糟糕的是，并不是所有的近距离支援都获得了同样的成功。在11月26日，马扎里沙里夫被攻克后，塔利班和基地组织战士被关在卡拉伊坚吉(Qala-i-Janghi)附近一座被当成监狱的要塞里，这些人在那里发起了暴动，占领了军火库，并打死了中情局探员乔尼.斯潘(Johnny Spann)。第10山地师立刻呼叫空中火力支援，而一支英国皇家特别空勤团的小队在监狱附近与北方联盟的部队一起作战。VF-102中队的维护官和他的后座正驾驶着第二架飞机前往现场。
“我的飞行员和我正在用战术侦察吊舱在阿富汗北部侦察，然后‘Bossman’在骚乱升级之后呼叫了我们。”这名雷达拦截官回忆道“我们不知道监狱里的情况是如何的糟糕，因为‘Bossman’只是让我们在半路上调头前往马扎里沙里夫，与那里的一名特种部队联合战术空中管制员取得联系。我们将无线电调至被指示的那个频道，然后听着地面上发生的一切。在我们前方3分钟路程处是VMFA-251中队的2架大黄蜂，它们是第一批抵达现场的战术飞机，我可以听得出地面上的特种部队和天上的飞行员之间有一些困惑。
“我把发给大黄蜂长机飞行员的JDAM炸弹投放坐标写下，同样还有友军部队的位置，并迅速将其输入任务计算机。我的飞行员立刻询问敌人和友军之间的距离是多少，而我回答说他们离得太近，根本无法区分----两个坐标之间的距离不足300米。糟糕的是，后者通过错误的方式被发送给那名疑惑不解的飞行员，而扔下的那枚2000磅GBU-31炸弹直接命中这个坐标的位置，炸死了6名北方联盟的战士，炸伤了5名美军。
“这枚JDAM爆炸后无线电里是死一般的寂静，两边胶着的战斗都停下来了。这名大黄蜂飞行员试图与特种部队T小队取得联系，但没有回应。这不是一个好的信号，过了90秒钟，无线电的那头传来的声音并大叫着‘停火，停火，停火！’我们知道这枚炸弹炸错了目标。
“当天的天空上没有云朵，而监狱的骚乱远远地就能看见，作为激光制导炸弹轰炸的目标相当清晰，同时我们可以和联合战术空中管制员谈论关于目标区的事宜。着将大幅降低我们的炸弹炸中己方部队的概率，因为你可以通过前视红外热像仪来瞄准需要轰炸的目标。你无法用JDAM来这么做，此外，你还要希望联合战术空中管制员发给你的坐标是正确的。
“我们下降到15000英尺高度，给那座要塞拍了照片，但没有再降得更低，因为肩扛式地空导弹的威胁。除了拍照以外，我们在要塞上空盘旋时还做了很多的记录，以便在CVW-1联队于任务后的简报中提供帮助。”
这样的事情无法阻止北方联盟的部队从南方向坎大哈推进，这里是塔利班的精神中心。这也是12月初敌人最后的一座坚固的要塞。同样从南方挺进的还有哈米德.卡尔扎伊的普什图族军队，再次由特种部队提供支援。为了消灭地面上的坚固阵地，CTF-50特混舰队在12月1日一天就派出了90架次的战术飞机----美国空军又派出了44架次的攻击机和重型轰炸机。面对着如此强大的空中力量，市区内的所有抵抗都在12月4日停止了，敌人的残余部队都逃向了坎大哈东北部的山区里。
2001年12月，VF-102中队的联队长机正在向黑山洞地区飞去，飞机的机腹上挂载了2枚Mk83和2枚GBU-12。“12月初的一些任务里，我们不得不在海上扔掉大量的激光制导炸弹再着舰，因为我们找不到要轰炸的目标。”一名VF-102中队的飞行员回忆道，“起飞时仍旧挂载了4枚GBU-12，就像我们之前在10月和11月做的一样。随着坎大哈被攻陷后一切都趋近于平静，我们不得不在着舰前扔掉其中2枚，以降低飞机的重量。
“然后决定我们应该混挂不同种类的炸弹，这样可以扔掉2枚铁炸弹，把更贵的激光制导炸弹留下来。当黑山洞作战开始后，我们就不用担心把炸弹带回来的事了，但我们还是继续混挂不同种类的炸弹，我扔下过4至5枚铁炸弹，其中2枚用于轰炸阿富汗北边搭载武装分子的卡车----抵达那里之前，我们已经用掉了飞机上的GBU-12。
“在这次任务期间，我记得跟自己之前在VF-101中队里的学员交谈过。我坚信海军不会让一架装有老旧轰炸系统的雄猫去战场上扔铁炸弹！然而4年后，我就在这么做。
“飞机在以45°角俯冲的时候投弹，让飞机对准目标，保证在投弹时不会有很大的偏差。这些500磅的Mk82和1000磅的Mk83对于像车辆和开阔地上的部队这种大型目标来说很有效，你不会去试着把一枚这样的炸弹扔到一幢建筑的门前。在这50枚铁炸弹里，绝大多数都是在昼间投放的，因为在夜间很难精确瞄准目标。”
黑山洞(普什图语：تورا بورا，Tora Bora)
坎大哈的陷落标识着塔利班对阿富汗统治的结束，中央司令部将注意力转移到寻找在巴基斯坦边境东侧中部的黑山洞地区里寻找残余的基地组织武装分子。再次，舰载机力量在这次行动中起到了关键作用，在战斗期间，特种部队和中情局的小队与空袭互相配合，从12月10日一直打到19日。
因为几乎快要结束持久自由行动的部署，CVW-11联队在黑山洞作战的准备阶段只起到了很小的作用。VF-213中队执行了大量的X近距离空中支援任务，帮助地面部队进入黑山洞周围的斯平伽尔(Spingar)山区里。克里斯.伽斯科(Kris Gasko)上尉和托尼.托马中尉在12月7日晚参加了战斗。
“我们在这次任务中的长机由于蓝丁吊舱的故障而被留在了航母上，因此我们独自起飞，并在‘Shamrock’点上等待备用机抵达。”托马解释道“备用机的蓝丁吊舱也无法使用，所以我知道我得去找到并照射所有被发现的目标。我们到‘K-Mart’(预警机)那里报到，然后被告知前往黑山洞那里与‘Cobra 25’联系，他们在这一天抵达了这片区域。
“收到的情报清晰地指出奥萨马.本.拉登在这里躲藏的位置，但山区里层层设防。