整个1980年代，交付给阿富汗空军具体飞机数量仍然未知，但肯定达到了数百架：据估计，在1980年代末和1990年代初，各种类型的飞机的数量从350架到400架不等。除了打算出口的新机以外，苏联转手给阿富汗空军的大量飞机都是直接来自苏联部队的二手货：许多苏-17M2和M3，以及米格-21、直升机和运输机以这种方式抵达阿富汗。
当苏联从阿富汗撤军时，他们开始努力提升阿富汗空军的能力，使得后者的实力达到了历史最高水平。因此，阿富汗空军在1980年代末和1990年代初的行动强度达到了前所未有的程度：到1989年，空军每天能够进行200至250架次的飞行，最高可达300至400次。必要时，一些喷气式飞机飞行员每天执行五次以上的作战任务。自然，维持如此疯狂的作战节奏需要消耗海量的燃料和弹药，这两种物资每天都从苏联大量涌入阿富汗。
不出所料，阿富汗空军遭受的损失达到数百人：纳吉布拉政府前国防部副部长穆罕默德.纳比.阿齐米(Mohammad Nabi Azimi)将军声称，从1978年的社会主义革命到1992年4月纳吉布拉倒台，空军损失了617架飞机和651名机组人员。虽然其中一些人成为媒体广泛报道的毒刺导弹和圣战者其它防空武器的受害者，但许多装备----特别是直升机和运输机----在地面上被机枪和炮火摧毁。上述损失的很大一部分也是由于飞行员失误、缺乏纪律或技术问题造成的。根据另一个消息来源(维克托.马尔科夫斯基的《Ан-12 в Афганистане》，译者以后会抽空整理并翻译)，仅在1989年，阿富汗空军就损失了109架各类飞机。
322团驻扎在巴格拉姆空军基地，使用多种不同型号的米格-21。根据迷彩图案判断，这架米格-21比斯属于1980年代末交付的机体之一。值得注意的是安装在机身中部较低位置、机翼下方的红外干扰弹/干扰箔条发射器。
尽管在撤军期间，苏联提供了阿富汗军队所需的大部分物资，但由于大量缺乏训练有素的人员，许多军事基地的军事硬件被闲置：事实上，阿富汗军队的每个军种都严重缺乏能够使用新装备的人员。阿富汗空军也无法避免这些问题。虽然在1980年代，数千名飞行员及机械师在苏联和阿富汗接受了培训，但由于新交付的飞机数量庞大，损失惨重，因此仍然需要补充新的飞行员。
总体而言，据报道，大多数阿富汗飞行员来自普什图或塔吉克贵族家庭；喷气式飞机飞行员通常来自最富有的阶层，而其它型号飞机的飞行员则来自收入较低的阶层。如果是真的，则表明选择过程中存在一些腐败。毫无疑问，飞行员被认为是阿富汗武装部队的精英，可是新兵的素质往往不够。例如，1990年秋天，一个苏联医疗委员会抵达喀布尔，为苏联飞行学校挑选60名学员，在2500名候选人中，只有35人被录取，主要原因是候选人的文盲程度和健康状况不佳。由于缺乏训练有素的机械师，阿富汗空军维护装备的能力也受到了限制：直到1989年，国防部才重视起阿富汗军队所有军种的机械师培训。
除上述问题外，影响政府军开展有效反穆贾希德运动能力的一个严重问题不仅是出现个别逃兵，而且是整个部队大规模叛逃到反对派一侧。从1978年的社会主义革命到1992年，可能有数十万军队转而反对政府，或者干脆逃跑。不足为奇的是，叛逃率在新兵中最高，这些新兵往往对宣扬无神论价值观的政权毫无同情心----尤其是农村的传统社会----认为那是非伊斯兰、不道德或彻头彻尾的邪恶。叛逃事件甚至发生在普遍忠诚、亲政府的阿富汗空军中。
例如，1989年7月6日，詹.帕兰德(Jan Pahrand)大尉驾驶他的苏-22M4“红804”飞往巴基斯坦的白沙瓦。1989年9月29日，22岁的大尉贾拉尔.乌丁.瓦尔达克(Jalal Uddin Wardak)跟随帕兰德飞往白沙瓦，并请求政治庇护。有趣的是，1996年，当他的米格机被运往卡拉奇的巴基斯坦空军博物馆时，这位飞行员回到了阿富汗，重新开始了他的职业生涯，为塔利班服务。1989年2月，两架米-35飞机降落在潘杰希尔山谷，他们的飞行员连同四名共产党军官叛逃到艾哈迈德.沙阿.马苏德一侧。塔吉克指挥官无法在战斗中使用这些飞机，因为他缺少燃料，也没有设备来维护它们，这些直升机在战争的这一阶段完好无损地幸存了下来，后来又重新投入使用。
阿富汗的主要空军基地和当地部队(至1992年)。
从1980年代到1992年，圣战者们没有建立任何自己的空军，可是他们完整地缴获了许多直升机，或者只造成了轻微损坏。原因是，圣战者根本没有任何支援来维持飞机的运转，即使他们将任何一架直升机恢复到可飞行状态，并找到飞行员驾驶，这些直升机也可能很快就被苏联或阿富汗空军摧毁。例如，当几架米-8误降落在库纳尔省一座刚刚被赫克马蒂尔的伊斯兰党游击队占领的驻军大院，不久之后，阿富汗空军就空袭了该地点。因此，叛逃到潘杰希尔的那两架米-35的幸存更多地被视为一个例外，而不是常态。
虽然圣战者没有空军，但他们逐渐发展了强大的防空能力，并能够给阿富汗造成严重损失。在美国向圣战者提供的先进防空武器里，包括FIM-92“毒刺”肩扛式地空导弹起到的主导作用得到了广泛认可。苏联和阿富汗空军从内战一开始就遭受了相当大的损失，1986年引入“毒刺”只会使飞行更加危险，尤其是当飞机在下降、起飞后爬升或从“毒刺”的作战范围内展开攻击时。除了毒刺导弹外，圣战者还配备了美国的FIM-43“红眼”、中国的红缨-5和英国的“吹管”肩扛式地空导弹，并成功从阿富汗或苏联军队夺取了一些SA-7。DShK、ZPU-1和ZU-23-2等高射机枪/炮在全国各地司空见惯。