阿富汗伊斯兰酋长国空军的战斗机主要驻扎在坎大哈，而喀布尔、信丹德、赫拉特、贾拉拉巴德和马扎里沙里夫的机场也在需要时使用。例如，在巴格拉姆地区向马苏德和巴米扬周围的什叶派部队发动进攻期间，喀布尔机场特别繁忙。然而，没有迹象表明塔利班地面部队与他们的空军之间存在有效的合作：尽管米格和苏霍伊战机参与了该国的所有重大行动，但他们的飞行员并没有直接与地面部队协调，只是轰炸了在前线随机选择的目标，如果对集结区进行袭击，会造成巨大的附带损伤。
空袭的心理影响超过了其军事用途，例如，缺乏选择合适目标的适当程序，可以通过错失打击马苏德的机会来说明。马苏德在潘杰希尔山谷的一个地方销毁了多年储存的飞毛腿、蛙-7、BM-22和其它重型武器。除了一架运输直升机在塔鲁坎被毁外，阿富汗伊斯兰酋长国空军可能从未对联合阵线或外国飞机造成任何打击，这些飞机不仅经常出现在潘杰希尔上空，而且也经常出现在北部、东北部和中部省份的许多简易跑道和机场。
随着塔利班占领了阿富汗大部分地区，也随之缴获了各个空军基地的雷达和防空武器，逐渐具备了一定的防空能力。最初，塔利班的标准防空武器是无处不在的ZU-23-2高射炮，通常安装在苏联制造的吉尔-131卡车上，主要用于杀伤人员，但当喀布尔陷落后，塔利班俘获了一些SA-2、SA-3和SA-13地空导弹系统以及ZSU-23-4自行高射炮。似乎至少有一些SA-3、SA-13和ZSU-23-4仍在使用中，但它们可能从未击落过任何东西，因为它们距离任何实战区都很远。
塔利班SA-3与SA-13导弹的唯一照片证据来自喀布尔和坎大哈，在1990年代末和2000年代初，仅仅因为塔利班的对手几乎没有作战飞机，而珍贵的直升机和运输机几乎完全用于非战斗任务，所以没有看到任何空袭。早在1995年，塔利班就缴获了一些毒刺肩扛式地空导弹，可能还有一些SA-7导弹，但它们的实际状态和作战用途仍不得而知：很可能到了1990年代末，由于电池寿命的到期，它们已经没有用了。
关于巴基斯坦喷气式飞机对联合阵线的各种目标执行轰炸任务的报道相对较多。然而，没有确凿证据----照片或类似性质的证据----表明巴基斯坦空军飞机直接支援了塔利班的作战。这类指控通常来自反塔利班官员，这些可能被视为有偏见的消息来源。联合阵线的官员以及伊朗和俄罗斯的代表也多次报告说，巴基斯坦军队的士兵在前线与塔利班部队并肩作战，但没有提供任何证据。
虽然巴基斯坦宗教学校的学生在塔利班队伍中的存在不是秘密----联合阵线出示了他们的文件，并允许记者采访被俘的战士----但完全没有类似的证据表明巴基斯坦军队积极参与打击联合阵线的作战，但不能绝对排除这种可能性。然而，巴基斯坦三军情报局和巴基斯坦军队极有可能派出专家协助塔利班军队进行通信、后勤、培训、规划和其它活动，帮助建设阿富汗伊斯兰酋长国的武装部队并提高其作战能力。巴基斯坦还向塔利班提供资金、燃料、弹药和其它战争物资，并让数千名巴基斯坦宗教学校学生和极端组织成员能够定期进出阿富汗。
虽然塔利班在几次阅兵式上展示了他们的SA-2地空导弹，但他们的实际作战状态和可能的作战部署仍然是个谜。
然而，塔利班并不仅仅依靠巴基斯坦来维持酋长国空军的运作：1998年，塔利班航空部长曼苏尔亲自前往欧洲，在那里购买了飞机零部件和机场设备。毛拉.内克.穆罕默德(Mullah Nek Mohammad)曾在德国的法兰克福市担任当时塔利班政府驻欧洲的非官方特使，据他说，曼苏尔从捷克和德国公司购买了他需要的东西。穆罕默德回忆道：“当时，塔利班政权还没有遭到联合国制裁，曼苏尔为机场购买了大约四个装满物品的集装箱和一些油罐。”
根据各种消息来源，1996年后，塔利班向基地组织转交了几架运输直升机，用它们将臭名昭著的055旅的民兵和该组织的领导人运送到全国各地。例如，一名后来在比利时受审的恐怖分子嫌疑人目睹了奥萨马.本.拉登乘坐私人直升机在阿富汗城市之间穿梭。因此，可以说，在1990年代末和2000年代初，基地组织在阿富汗的分支实际上建立了自己的小型空军。
武装联合阵线
随着喀布尔陷落、马利克叛乱和反塔利班阵营的进一步受挫，塔利班的威胁越来越大，俄罗斯、伊朗、乌兹别克斯坦和塔吉克斯坦加强了对阿富汗内战的参与，然而，这种支持从未达到沙特、一些海湾国家、巴基斯坦支持塔利班的范围和强度。
俄罗斯和塔吉克斯坦主要向被推翻的拉巴尼政府，即马苏德的部队提供援助，乌兹别克斯坦支持杜斯塔姆，伊朗继续支持统一党，最终每个国家都向相应的某个反塔利班政党提供了某种形式的援助。对于马苏德的部队来说，俄罗斯的支持至关重要，因为从马苏德领土到外部世界的唯一合理陆上交通路线就是通过塔吉克斯坦，俄军第201师仍然驻扎在那里，守卫着边境。俄罗斯不仅向拉巴尼政府提供了直接援助，允许从塔吉克斯坦越过边境运送物资，而且还协调了从伊朗通过前苏联中亚共和国向阿富汗转移的地面援助。
从国外获得武器的关键是拉巴尼政府赚钱的能力。据报道，沙特阿拉伯在1993至94年间向拉巴尼政府提供了1.5亿美元，拉巴尼还从一个身份不明的北约国家获得了价值500至1000万美元的武器，但到了1990年代末，沙特将援助转移给了塔利班，而拉巴尼政府的资金相对较少。例如，通过出售在潘杰希尔山谷和政府控制的其它地点开采的青金石和祖母绿，拉巴尼政府每年能够获得700万至1000万美元的小额收入。剩下的收入可能来自生产和运输毒品，但不知道这是特定指挥官的私人业务，还是拉巴尼政府自己秘密组织的。据报道，马苏德的空军司令道兰将军承认，在1990年代末，他的直升机经常通过边境向塔吉克斯坦运送毒品。此外，如下文所述，印度还向拉巴尼政府提供了额外资金。