塔鲁坎之战
由于杜斯塔姆和统一党实际上已经出局，唯一足以阻止塔利班控制整个国家的力量仍然是马苏德的部队，他们控制着两条重要的前线：一条在喀布尔以北，另一条在塔哈尔省。预期中的夏季攻势始于2000年7月1日打响。塔利班及其支持者将大部分精力投入喀布尔北部的战场，在那里曾发生过两次大规模战斗。盘根错节的潘杰希尔军队两次获胜，这可能是塔利班将注意力转移到北方的原因之一。
在乌兹别克斯坦伊斯兰运动、阿拉伯和车臣圣战分子、巴基斯坦宗教学校学生以及巴基斯坦军方和三军情报局特工的帮助下，塔利班逐渐占领了喷赤河沿岸的城镇，并很快开始对塔鲁坎反对派司令部发动大规模进攻，巴基斯坦国家元首穆沙拉夫将军公开宣布支持塔利班及其行动。
塔利班连续六周围攻这座具有重要战略意义的城市，但都没有成功，且损失惨重。最后，在2000年9月5日，马苏德的部队无法承受塔利班袭击的冲击，从塔鲁坎以东撤出。阿富汗伊斯兰酋长国空军参与了大量战斗，也遭受了重大损失：据报道，8架米格-21和苏-22在塔鲁坎上空被肩扛式SA-14地空导弹击落，马扎里沙里夫空军司令、塔利班空军最杰出的飞行员之一，阿拉赫达德将军----驾驶的米格-21于2000年8月6日被击落----对阿富汗伊斯兰酋长国空军来说是一个特别沉重的打击。马苏德在这一时期的飞机损失很小：根据现有报告，塔利班在空袭塔鲁坎机场时摧毁了伊斯兰社会党最后一架作战用的安-12。
塔利班运动在北方取得的胜利意义重大，有可能为巴达赫尚省开辟一条道路----巴达赫尚省是最后一个完全由反塔利班联盟控制的省份----联合国认可的阿富汗政府已将其首府转移到巴达赫尚省。马苏德接受了塔塔鲁坎的陷落，但并不打算撤退到巴达赫尚。他的手下在这座城市的东北部建立了一条新的前线，决心尽可能多地控制土地，而伊朗、俄罗斯和站在反塔利班联盟一侧的两个中亚国家同意进一步加强对马苏德的支援。
从后勤角度来看，塔鲁坎的陷落严重影响了从塔吉克斯坦向联合阵线控制的领土深处转移物资的工作。虽然塔利班未能占领塔鲁坎以北数千米处的夸贾盖尔(Khwaja Ghar)简易机场，但由于太靠近前线，该机场不得不关闭。在此之前，包括最后一架投入使用的安-12在内的各种伊斯兰社会党空军的运输机定期降落到机场跑道上，带来武器、弹药和其他补给，而且这里也曾被伊朗C-130使用。
因此，塔鲁坎战役失败后，反塔利班部队最后一座适合运输机降落的机场是巴达赫尚省省会法扎巴德郊外的机场，但机场周围地区由自治指挥官控制，只要拉巴尼政府给他们送钱，他们就与拉巴尼政府合作。据报道，1999年在伊朗援助下修建的达什特卡拉(Dasht-e Qala)机场位于横跨喷赤河的大桥附近，但是离前线太近，无法使用，而从塔哈尔省到潘杰希尔的主要陆路路线已经被塔利班封锁。这种岌岌可危的局势进一步突显了马苏德的小型米-17直升机部队的作用，这些直升机在为潘杰希尔河谷以及偏远地区联合阵线的抵抗武装提供补给方面发挥着绝对必要的作用。
2000年9月，塔利班试图从巴基斯坦边境附近的高山渗透到东南部的巴达赫尚省。这次袭击可能是对塔鲁坎周围前线僵局的反应，进攻发生在一个此前相对平静的地区，塔利班可能认为该地区的防御能力远不如马苏德在塔哈尔难以突破的阵地。然而，塔利班攻势在2架米-24直升机的帮助下被击退。
塔利班酋长国最后的岁月
自2000年9月塔鲁坎陷落以来，阿富汗的军事局势相对稳定，可是马苏德的部队在塔鲁坎以东和以北的塔哈尔省抵抗塔利班时偶尔会发生交火。马苏德控制着城外的群山，并利用廓克查河作为一个天然的障碍物组织军队，成功地击退了塔利班的每一次袭击。
2001年8月，2架塔利班米-25/35和1架米-8/17飞越喀布尔的阅兵式现场。
2000年夏末，阿富汗伊斯兰酋长国空军获得了一次难得的机会，击落了一架于坎大哈地区飞行的中情局MQ-1捕食者无人机。随着美国加大追捕或彻底击毙奥萨马.本.拉登的力度，他们开始在乌兹别克斯坦南部的一座机场秘密操作捕食者。这些小而慢的无人机到可疑的建筑群上空飞行，没有受到干扰，直至9月的一天，坎大哈机场的一个人注意到附近有一架无人机在飞行。一架米格-21立即升空，但未能击落无人机。根据无人机操作员的说法，米格机三次掠过无人机后才返回基地。显然，塔利班飞行员的接近速度太快了。
2001年初，阿富汗中部前线出现了意想不到的事态发展。杜斯塔姆将军自1998年战败以来一直在土耳其流放，马苏德鼓励他返回阿富汗，领导马扎里沙里夫以南的乌兹别克游击队，而伊斯梅尔.汗在2000年试图在阿富汗重建家园，但没有成功，他最终于赫拉特以东的山区里拉起了一支伊斯兰社会党的武装。第三位流亡的联合阵线指挥官是什叶派统一党的卡里姆.哈利利，他返回后亲自领导自己的组织。
哈利利已于2000年12月被马苏德的一架直升机接到巴米扬省，自那以后，他的组织一直定期袭击塔利班阵地，甚至在2001年2月短暂地夺回了巴米扬镇。促使马苏德组织这次指挥官“重聚”的动机来自塔利班进攻的危险，许多人预计，这场进攻将于冬季积雪融化后不久开始。虽然到目前为止，马苏德能够守住他在塔哈尔的阵地，但每个人都知道下一轮战斗将是最激烈的。与前几年一样，塔利班的队伍得到了巴基斯坦宗教学校学生、基地组织恐怖分子和伊斯兰穆斯林联盟战士的支持，而塔利班的军事行动则得到了巴基斯坦军官的建议。马苏德显然希望，阿富汗中部反塔利班组织加强军事活动，把一些本来用于抵御塔哈尔攻势的部队派出去与塔利班交战，从而减少塔利班进攻的威胁。