当塔利班接近喀布尔之际，拉巴尼政府试图将他们描述为打击赫克马蒂亚尔的盟友，可是塔利班强烈否认了这一点，并强调他们的部队事实上是中立的，不会与任何圣战组织政党合作，根据他们的说法，这些政党都同样恶劣。然而，值得注意的是，赫克马蒂亚尔战败后，当拉巴尼政府和塔利班第一次面对面时，他们的关系虽然复杂而紧张，但并没有完全敌对。政府对塔利班的和解态度可以从政府愿意将查哈尔阿西亚布基地割让给他们来说明，该基地是政府军在赫克马蒂亚尔撤军后迅速占领的。在场的记者还注意到，马苏德在巴格拉姆的技术员们正在为塔利班维修至少一架被缴获的米-17直升机。
与此同时，在喀布尔，赫克马蒂亚尔的失利减轻了政府军的压力，使艾哈迈德.沙阿.马苏德有能力采取一项行动，旨在清除首都其他正在与政府争夺控制权的势力。在喀布尔西南部的一片小飞地里，仍有杜斯塔姆特遣队的残余人员，而什叶派的统一党控制着西郊。出乎意料的是，马苏德的攻势发展成了一场战斗，不仅使喀布尔完全处于政府控制之下，而且还结束了政府与塔利班之间脆弱的和平，使迄今无敌的极端伊斯兰运动遭到严重挫败。
马苏德的部队攻击统一党阵地期间，事态开始发展。其领导人阿卜杜勒.阿.马扎里已经与塔利班进行了一段时间的谈判，遭到政府军的袭击后，他公开向塔利班寻求帮助。根据最终达成的协议，塔利班本应介入什叶派与马苏德的部队之间，控制统一党在前线的重型武器，并充当中立的缓冲势力。不过，并不是每个人都对这笔交易感到满意。当塔利班部队前去接管统一党部队的武器时，后者转而向塔利班开火，大批什叶派武装加入了该党的一个分支派别，该派别隶属于政府，并与马扎里的部队发生交火。安东尼.戴维斯(Anthony Davis)是一名记者，多年来一直在报道阿富汗战争，他对以下事件进行了描述：
“马苏德是否真的同意塔利班进入喀布尔西南部仍然是个未知数。但不管塔利班相信什么，他都无意让他们留下来。把一个敌人推到墙边后，他不打算让另一个作为‘中立’的力量介入进来，并追求其在喀布尔统治的既定目标。经历了短暂的平静之后，他于3月11日星期六上午晚些时候再次发动进攻，派出了政府军队的全部力量。由于统一党的叛逃者在前苏联和波兰大使馆设置了封锁点，政府军的装甲部队在米-35武装直升机和苏-22战斗轰炸机的支援下，冲向了达鲁拉曼大道。塔利班和统一党对市中心发动了猛烈的报复性火箭弹袭击，同时造成数十人伤亡。然而，到下午晚些时候，政府军已经向南推进到城市外缘的达鲁拉曼宫破旧的外围，洗劫了什叶派的驻地，政府军正在清除他们身后的抵抗力量。”
马苏德决心利用自己的成就，继续乘胜追击，接下来的几天里，他的部队把塔利班从查哈尔阿西亚布赶走，并占领了喀布尔以南的里西科尔(Rishikor)军事基地，将敌人进一步赶向首都的西部和南部。马苏德还占领了达鲁拉曼附近的飞毛腿导弹基地，该基地自1992年以来一直由他的敌人控制。多年来，喀布尔首次脱离敌对武装的火力射程。
统一党领袖阿卜杜勒.阿里.马扎里未能说服塔利班，他手下的一些人对塔利班“缓冲部队”的袭击是一场真正的、意外的叛乱。塔利班指控马扎里不守信用，设法抓捕他，并准备用直升机将他带到坎大哈。然而，在直升机抵达目的地之前，马扎里和他的亲密助手在不确定的情况下坠机身亡。这一事件使得塔利班和阿富汗什叶派之间未来几乎不可能存在任何和解：统一党选举了一位新领导人卡里姆.哈利利(Karim Khalili)，他在最初与塔利班的调解后展开了激烈的战斗，直到后者于2001年底被推翻。
喀布尔前线出人意料的事态发展也标志着杜斯塔姆在阿富汗这一地区的存在的彻底结束。这名乌兹别克将军的部队仍占据喀布尔附近的一个地区，当双方达成协议后，塔利班解除了他们的武装，并利用可用的道路撤离到马扎里沙里夫；另外300名被塔利班带到坎大哈的民兵后来被杜斯塔姆派出的运输机接走。
伊斯梅尔.汗的埃米尔国的倒台
在塔利班于喀布尔城门失利的同时，他们于阿富汗西部取得了闪电般的进展。尽管巴基斯坦三军情报局内部的支持者警告说，塔利班没有为这样一项雄心勃勃的事业做好准备，但塔利班领导人还是决定对伊斯梅尔.汗发动攻击，大胆的目标是夺取赫拉特。起初，一切顺利，伊斯梅尔.汗在尼姆鲁兹和法拉两省的当地普什图盟友----其中许多人实际上不喜欢他的举止----要么逃离，要么加入了势如破竹的塔利班。3月底，塔利班沿着连接南部坎大哈和西北部赫拉特的公路快速前进，随后向信丹德空军基地逼近。
与此同时，伊斯梅尔.汗的指挥官在北部与杜斯塔姆的封地接壤的巴德吉斯省面临战斗升级。在这里，由杜斯塔姆的将军拉苏尔.帕拉旺(Rasul Pahlawan)领导的部队----伊斯梅尔.汗的主要敌人----发动了一场攻势，虽然没有塔利班在南部的闪电战那样具有威胁性，但仍然必须认真对待，尤其是帕拉旺在当地伊斯梅尔.汗的敌人的帮助下占领了重镇巴拉穆尔加布(Bala Murghab)之后。