北方运动/全国伊斯兰运动/杜斯塔姆将军的空军
1990年代阿富汗内战中规模最大的空军可能是属于阿卜杜勒.拉希德.杜斯塔姆的。这名乌兹别克将军在北部省份没有足够强大的真正反对派来挑战他，他早在1992年4月之前就占领了马扎里沙里夫最重要的空军基地。据估计，杜斯塔姆的空军大约有60架飞机可供使用。他的第一任空军指挥官是穆罕默德.穆斯塔法(Mohammad Mustafa)将军，他于1994年在空战中阵亡，由后来叛逃到塔利班的阿卜杜勒.贾米勒(Abdul Jamil)将军接替。与该国其他地区相比，阿富汗北部的战斗相对较少，驻扎在那里的政府军部队，包括空军，都保持了完整。杜斯塔姆组建了一支精干的军队，甚至继续使用雷达，可能还有SA-3防空导弹。
至少在一开始，杜斯塔姆的空军可以依赖苏联在阿富汗北部建造的大型阿富汗陆军仓库提供的燃料、备件和弹药；这是其它派系无法获得的优势。杜斯塔姆的组织建立在共产主义政权管理的基础上，并由大量前政权人物组成，飞行员和其他专家一般没有理由放弃工作。尽管杜斯塔姆控制着喀布尔国际机场，使他能够在1994年之前为首都的部队提供补给，但该机场的重要性因频繁的火箭弹和炮击而严重削弱，这些袭击摧毁了飞机、设备和跑道，导致起降成为了危险的冒险。
20世纪90年代，吉尔-131卡车通过添加ZU-23-2等轻型高射炮改装成“武装”卡车在阿富汗随处可见。它们几乎只在地面作战中使用，而且鲜有对空战果。这张照片仍然来自一段视频，里面显示一辆吉尔-131在马扎里沙里夫的一条街道上行驶，挡风玻璃上挂着将军的肖像和一个巨大的全国伊斯兰运动徽章。
伊斯兰党/古尔布丁.赫克马蒂亚尔的空军
共产主义政府军第21师与赫克马蒂亚尔的政党结盟后，阿富汗西部的一座主要军事基地信丹德机场被伊斯兰党的民兵占领。令他们惊讶的是，当民兵指挥官从共产党军官手中接管该基地的控制权时，他们发现伊朗特工正为沙漠风暴行动中从伊拉克逃到伊朗的苏-22战斗轰炸机搜集并转移零配件。
在纳吉布拉政府垮台之前或之后的混乱日子里，不知道伊朗人是否真的从阿富汗获得了任何飞机部件，但他们的努力很可能毫无结果，特别是考虑到逊尼派伊斯兰党的反伊朗立场。从理论上讲，控制新丹德让伊斯兰党可能拥有相当规模和实力的空军。然而，当赫克马蒂亚尔接管信丹德时，那里并没有多少飞机，可是他吹嘘说，在信丹德被伊斯兰党控制后不久，他的武装就组建了一支空军。
尽管在1990年代初的权力斗争中，伊斯兰党是主要参与者之一，可是他们似乎没有采取任何措施来建立一支真正发挥作用的空军，甚至无法或不愿向驻扎在信丹德的空军人员支付工资。在机场被伊斯兰党控制期间，留在基地的少数几名飞行员完成了一些战斗架次，但在1992年10月伊斯梅尔.汗的部队成功夺取机场之前，这座一度繁忙的基地可能并不活跃。据报道，在赫克马蒂亚尔位于喀布尔南部查哈尔阿西亚布(Chahar Asiab)的指挥部，至少有五架直升机仍在其“支援小队”的私人警卫部队的控制下活动，但其战斗部署不详。
伊斯梅尔.汗的空军
伊斯梅尔.汗是伊斯兰社会党的成员，1992年4月，驻扎在赫拉特市的第4军与他结盟时，他获得了前政权的飞机。目前还没有关于机场飞机数量或总体状况的报告，但据了解，伊斯梅尔.汗的飞机直到1995年底才投入使用，他的一些直升机至少到1997年才投入使用。1992年10月，伊斯梅尔.汗击败该地区的伊斯兰党民兵后控制了这座空军基地，占领信丹德后，他的部队获得了更多的装备。
1990年代，可能阿富汗所有主要派系的军阀以及一些影响力较小的指挥官的武库中都有一些FIM-92毒刺导弹。在赫拉特的阅兵式上，三名塔利班士兵展示了他们于赫拉特前线缴获的武器。
毛拉.纳奇布拉的空军
坎大哈的大型国际机场由哈吉.艾哈迈德控制。哈吉.艾哈迈德是斯平博尔达克(Spin Boldak)的圣战领袖，也是临时总统穆贾德迪的国民解放阵线的追随者。后来，坎大哈机场被毛拉.纳奇布拉.阿訇接管，他名义上效忠于伊斯兰社会党。在坎大哈的复杂环境中，毛拉.纳奇布拉发挥了重要作用，共产主义政权倒台后，他的部队吸纳了政府军第2军。然而，圣战者接管坎大哈机场后，那里的飞行活动仍然很低迷，可用飞机的数量急剧下降。
纳吉布拉倒台后，统一党立即从前政权驻军手中缴获了大量重型武器。除其他硬件外，随后在喀布尔西部的一次阅兵式上展示了唯一一台SA-13地空导弹，然而，什叶派民兵可能缺乏训练有素的人员，无法在战斗中实际使用这种武器系统。
塞义德.曼苏尔.纳德里的空军
纳吉布拉政权倒台后组成的最后一支航空部队是杜斯塔姆的一名附庸塞义德.曼苏尔.纳德里(Sayed Mansour Naderi)。据报道，纳德里主要在巴格兰省使用了几架米-8或米-17运输直升机。1980年代，纳德里成为亲政府民兵领袖后，就在巴格兰建立了自己的封地。
随着内战的继续，至少有三四个额外的空中力量开始发挥作用：塔利班的、伊斯兰党的、乌兹别克将军马利克的，甚至可能还有基地组织的，但目前尚不清楚恐怖组织装备直升机的小型“空军”是否真的与塔利班的“空军”分离。
由于局势混乱，记者和学者对阿富汗某些地区的报道相对较少，进一步的研究可能会揭示，在1992年后的动荡时期，独立指挥官或较小的政党制造了更多寿命较短的空中武器。然而，反纳吉布拉武装中的主要机场的分布已经众所周知。