最先得到“阿里山八号”计划换装的单位是第12独立侦察中队。在“阿里山八号”计划中所获取的39架单座型F-104G中，有8架被改为RF-104G型侦察机，交付此前因事故损失仅剩2架飞机可用的第12独立侦察中队使用。在这8架飞机中，4365、4392、4398、4400号RF-104被改为可以携带先进的LOROP“始安”远距离相机机头的RF-104G，简称为“始安机”，另外4架编号为4386、4391、5663、5664的F-104G则被改进为装备机腹KS-125相机的普通型RF-104G。
RF-104G“始安机”最大的特点是拆除了机头的雷达，改为专门安放照相设备的圆锥状机头照相舱。“始安机”能够在40海里以外清晰地拍摄侦察对象，在服役后常被用来对大陆沿海目标进行“擦边球”式的照相侦察。第12中队此时仅剩的5628和5632号RF-104G则被恢复为常规F-104G战斗机构型，分别改编号为4401和4402，重返第3大队服役（这两架飞机后来都毁于事故）。此外该中队还获得2架编号为4180、4182的TF-104G。这些飞机的交付服役时间分别是：1983年4月2日（2架TF-104G），6月21日（2架“始安机”），7月14日（2架“始安机”和2架KS-125A机），9月15日（2架KS-125A型机）。
第3大队“阿里山8号计划” F-104G机群，摄于90年代
第二个接收“阿里山八号”机的单位是清泉岗基地第三大队。1983年6月19日，第三大队接收10架TF-104G和5架F-104G。
1983年7月20日，新竹第499联队41中队正式进驻清泉岗基地，开始F-104G换装训练。该中队派出的首批“星战士”种子教官为领队王汉宁上校（第11大队副大队长），窦柏林，刘屏藩，徐宁远，喻志攻。所负责41中队的对口训练教官为来自第3大队的莫汉伟，裴浙昆，薛东兴，陆永维，沈远台和应嘉生。同年9月1日，裴浙昆中校接任第41中队长，继续领导原班人马和从第11大队41、42中队新选拔的岳修齐，田定忠，游永松、王镇一，孙永惠，邹承光、张明仁等7人完成训练。此时的第499联队长为大名鼎鼎的唐飞上校（后在联队长任内晋升少将），第11大队长为陈声勋上校，后为王汉宁上校接任。
“阿里山八号”计划所交付的11大队二手F-104G，摄于90年代
1984年1月1日，第42中队开始移防清泉岗基地进行F-104G换装训练。该中队首批F-104G种子飞行员为钟申宁中队长，杨春霖，宋台生等。
由于第11大队48中队的F-100“超佩刀”战斗机在1984年6-8月间连续发生三起因老化而导致的坠机事故，所以空军于同年9月5日正式提前退役了全部的“超佩刀”。原本不属于“阿里山八号”换装的48中队从1985年4月起开始赴清泉岗基地进行F-104G换装训练，首批种子教官为陈燮祥中队长，江泰广，潘斗台等。在第11大队3个中队先后赴清泉岗基地进行换装训练之际，新竹基地也从1983年起进行了为期三年的大整修，以配合F-104的使用和维护设施要求。
第499联队（包括三支飞行中队和附属的地勤支援分队）于1986年完成了全部F-104G“星战士”换装训练，正式返回新竹基地驻防，标志着“阿里山八号”计划正式全部圆满达成。第11大队也是台空军继第3大队完成换装F-104二十多年后所拥有的第二支“星战士”大队，首任大队长为陈盛文上校。第499联队完成换装“星战士”后的首任联队长为范里少将。第499联队下属的军械电子维修中队则迟至1989年才返回新竹基地。