炸桥
1965年4月，滚雷行动的第二阶段开始，美军的空中力量开始集中轰炸北越的公路、铁路和桥梁。对于F-105飞行员来说，这个阶段是整场战争中最苛刻、花费代价最高的一部分。起初，攻击行动和第一阶段一样在20°线以南，但从滚雷9行动开始向北轰炸。夏普将军挑选了三座桥梁作为攻击目标，清化的咸龙(Ham Rong)大桥----在河内以南仅70英里处----被分配给美国空军。这座桥横跨马江(Son Ma)，周围密布高射炮，这座桥成为了F-105的累赘，直到1972年才被炸毁。清化大桥1964年在中国建筑师的指导下建成，56英尺宽，全长540英尺，由钢筋和混凝土制成，它的坚固程度要远超出任务策划者所想象的。
4月3日第一次炸桥行动就动用了46架F-105，使用了254枚M117、32枚AGM-12A小斗犬和266枚2.75英寸的火箭弹。莱斯纳和他在柯叻的67TFS中队率领这支机群，后面是达欺的354TFS中队。小斗犬导弹因为无法精确命中桥梁的关键部位而收效甚微，炸弹只造成了无谓的损伤。F-105D为飞行员准备了一个小控制杆来控制导弹在飞机于18000英尺高度20°角俯冲时发射，这需要相当的合作以及飞行员高度集中注意力来观测导弹(而不是去躲避地空导弹或者高射炮)，每次通场只能发射一枚。
1965年初，唐.托藤(Don Totten)上尉爬进F-105的座舱，他的左小腿上绑上了一把丛林刀，带上了空中突击队的帽子(通常由基地里的裁缝制作，上面包含了飞行员的任务中的战果)还有求生物件。里面包括了一把0.38英寸口径的手枪、一根200英尺长的尼龙绳以便当飞行员挂在树上时能够爬下来、6发信号弹，还有一根金条，这些物品全重大约80磅。每次任务完成后都要更换被汗湿透的飞行服。
莱斯纳的飞机在这次攻击行动中又被击中了，但他安全地返回了基地，第二天，他按照麦康奈尔的要求策划下一场攻击。这一次，所有48架F-105上的小斗犬都被M117所取代。同样也没有飞机来压制高射炮火，因为一名401TFW联队的F-100飞行员在昨天激烈的战斗中被击落阵亡了。莱斯纳的计划由于恶劣天气以及加油机的迟到而被拖延，一些飞机不得不在大桥以南10英里处等待轰炸时间的到来。354TFS中队的"Zine"编队远离护航机群，结果遭到了4架北越空军921团米格-17的拦截(来自内排机场)，这些米格机从高空发起俯冲攻击，而F-105以375节速度飞行，满挂炸弹无法躲避北越米格机的攻击。
米格机长机飞行员陈翰向弗兰克.伯涅特(Frank E Bennett)的F-105D(59-1754)靠近，三炮齐发，打击致命。弗兰克驾驶着重伤的飞机向东脱离并在海面上跳伞，但是他在救援队来到之前就在湄岛(Hon Me)附近的海面上淹死了。就在剩下的F-105D试图转向米格机之际，陈翰的僚机飞行员黎敏焕向詹姆斯.马格努森(James Magnusen)的59-1764号机发起攻击，他在自己的飞机拖着火焰撞向地面时也没有跳伞。很快黎敏焕也被击落了，416TFS中队的飞行员唐.柯古斯(Don Kilgus)驾驶他的55-2894号机获得了F-100在整个越战中的唯一战果(但是没有被官方承认，因为当时种种政治方面的避讳)。另外两架米格-17也没有返航，看起来是被他们自己的高射炮击落了。约翰逊总统将这个空战战果看做是政治上的妨碍，并且声明他"再也不希望看见更多的米格机被击落了。"(这就是官方不承认柯古斯这个战果的主要原因)。另一架F-105D，67TFS中队的62-4217被高射炮击落，飞行员卡莱尔.哈里斯(Carlyle S Harries)跳伞后被俘。
1965年4月4日，416TFS中队的飞行员唐.柯古斯(Don Kilgus)驾驶他的55-2894号机获得了F-100在整个越战中的唯一战果(他后来成为了一名F-105G飞行员并再次来到越南战场)。约翰逊总统将这个空战战果看做是政治上的妨碍，并且声明他“再也不希望看见更多的米格机被击落了。”(这就是官方不承认柯古斯这个战果的主要原因)。
虽然遭受了300多处打击，但是40英尺厚的桥墩依旧耸立在江面上。这两架划归到921团帐下的F-105也是美军第一次在越战中被米格机击落的飞机。4月4日，5架EC-121D"大眼"预警机和新山一(Tan Son Nhut)基地45TFS中队的F-4C合作时曾断断续续发现过北越米格机的踪迹。
在1965年6月12日354TFS中队结束临时指派任务时，他们一共完成了1132个起落架次，还有5架飞机被击落，其中4人获救，另一人罗伯特.皮尔(Robert Peer，他的父亲在第一次世界大战时就是英国皇家飞行队的飞行员)于5月31日攻击咸龙大桥的一次行动中被高射炮击落，跳伞后被俘。他当时驾驶的是62-4381"Give'em'L"，那个时候很多F-105涂上了不起眼的小名。这些小名通常被刷在主翼前缘的进气口两侧以鼓舞士气。
第一次攻击清化大桥的行动结束后，354TFS中队又回到了他们轰炸交通路线的本职工作中来。4月5日，16架F-105轰炸了铁路以及9号公路，消灭了2列火车和一支卡车队。泰迪.盖(Teddy Gay)的F-105D 59-1742被高射炮击落，他之后被一架空军的HH-43直升机救走。
1965年4月6日，作为Two Buck Charle行动的一部分，23TFW联队563TFS中队被部署至泰国达欺基地，因此成为了美国空军自朝鲜战争后第一支参加了4个月作战部署的中队。到了1965年8月，他们的战斗经验在战区中是最丰富的。照片左边的62-4386在1966年5月31日被85mm高炮击落于安沛上空，飞行员里奥纳德.艾克曼(Leonard Ekman)中尉获救，右边的61-0134在战争中幸存下来，最后在弗吉尼亚州空中国民警卫队149TFS中队退役。
4月9日至15日的滚雷10行动的打击目标中又增加了5座桥梁和2座雷达站，雷公负责轰炸溪见(Khe Kienm)、贵永(Qui Vinh)和方甘(Phuong Can)的桥梁，而滚雷11行动中又增加了5座桥梁。演州(Dien Chau)和泰海(Thai Hai)大桥在4月16日被296枚M117炸弹临幸了，这是美军在一天中针对北越桥梁发起最大规模的一次轰炸行动。参与作战的包括41AD师的36TFS中队，他们在3月6日回到战区开始第二次轮战，这次是作为美国空军太平洋司令部旗下的一支中队。他们到达达欺后就立刻开始为F-105的运作做准备，就如他们上一年在柯叻所做的一样。他们和561TFS及563TFS中队的一部在一起，继续轰炸南越的桥梁，还有昏约岛(Hon Gio)、富文(Phu Van)和武公(Vu Con)的兵营，北越防卫最严密的清化大桥也少不了。
4月17日，F-105着重轰炸木甲小道，而美国空军也在这个地区损失了他们的第一架飞机。山姆.伍德沃斯(Sam Woodworth)没有从俯冲轰炸中改出，他和他的座机F-105D 61-0171都来自563TFS中队，这也是麦康奈尔基地23TFW联队作为Two Buck Charlie行动的一部分被派遣至达欺执行临时作战任务的两支中队之一。虽然在早期遭受了损失，但是563TFS中队在4月炸毁了6座公路桥，此外他们还参与了Fact Sheet行动，向北越投放了四百万张传单。
四月在轰炸另外8座桥梁和7个渡口的滚雷12行动中结束，F-105联队将这些目标在一周之内悉数摧毁。他们同样获准使用"连续攻击波"的方式来代替一次抵近式的攻击。武装侦察的任务也减少了，以使得找到目标的概率更高。虽然经常遭受高射炮的攻击，但这个月没有更多的F-105战损。
柯叻基地的停机坪上，令人窒息的聚硫橡胶盒炸药起动器在启动F-105 62-4356“Mumbles”发动机时烟雾弥漫。巨大的圆柱形的炸药启动器安装在飞机的机腹，由飞机的电池来点火，启动器将发动机转数从0提高到12%，然后飞行员才按下“启动”按钮。
接下来的两次作战里，5月的滚雷13/14将重点集中在42个交通运输目标上，其中包括了7日对清化大桥的轰炸，28架F-105是这支由64架飞机组成的大编队的主力，在354TFS中队查尔斯.沃特里(Charles Watry)少校的率领下向目标以及加强的防空火力网投放了356枚M117炸弹和304枚2.75英寸火箭弹。虽然他的飞机被高射炮击中后燃油泄漏，但他坚持呆在目标区上空，他也因此而荣获银星勋章。唯一损失的飞机是F-105D 59-1718，飞行员罗伯特.兰巴特(Robert Lambart)在海上跳伞后被一架HU-16B直升机救走。大桥再一次被炸弹临幸，但是在当天接下来的两次轰炸结束后依旧能够坚持使用下去。结果战术被修订了。
M117在任务中缺少穿透力，尤其是其错误的引信，此后直到AGM-12C小斗犬能够使用后才展开新一轮攻击。同样，F-105以大规模编队飞抵目标区上空时也无法帮助飞行员校准目标，因此，开始使用一支或者两支编队的小机群。这样的战术在第二天28架F-105轰炸Xom Trung Hoa的兵营时效果明显。
5月10日，约翰逊总统声明下令停止轰炸5天，没有迫使北越回到谈判桌前来，却给了F-105机群175次"目视侦察"任务，此外还有投放传单----1965年绝大多数投放传单的任务都是F-105完成的。