6月29日，负责河内防空的北越军官撤回了所有地空导弹阵地(卡斯勒后来推断，这导致他被撤职)。但是第二天，两支由12架F-105组成的编队轰炸太原和越池(Viet Tri)的储油设施时，目标区得到了良好的保护，导致攻击行动收效甚微，只有不到20%的目标被摧毁。388TFW联队的F-105D 62-4244中弹，飞行员罗宾.尼尔斯蒂(Robin Nierste)上尉驾驶受损的飞机飞行了200英里后安全跳伞。
虽然遭受了这些袭击，但是油料补给还是源源不断地从海防港运向北越腹地。约翰逊政府还禁止轰炸其他关键的油料储存目标，这意味着必须分批打击。在这些空袭之后，北越开始分散燃料储备，并将油桶藏在道路和河流旁。
1966年10月，麦克纳马拉告诉约翰逊总统，空袭储油设施的行动并没有改变河内的心态，对他来说，这进一步证明了轰炸北越永远不会赢得战争。许多其他人认为，很明显，在敌对行动开始时，就应该关闭海防的输油"水龙头"。
1966年1月15日，388TFW联队的四名飞行员完成了他们的第100次任务后，拿着香槟庆祝，他们是469TFS中队的布鲁斯.霍姆斯(Bruce Holmes)上尉(1967年1月在麦康奈尔空军基地附近的一场房屋火灾中丧生)和威廉.梅(William May)上尉，以及421TFS中队的理查德.伊利(Richard Ely)上尉和威廉.拉马奇(William Ramage)上尉。当布劳顿上校于1966年6月成为355TFW联队的副联队长时，飞行员的平均年龄为38岁。他们经验丰富，通常拥有硕士或博士学位。其中数人驾驶F-105完成了200次任务。然而，从 1967 年初开始，他们的"新人"替补往往缺乏战斗经验。
此时，詹姆斯.卡斯勒已经在北越被关了两个月，他的飞机是8月的头8天里被击落的11架F-105D/F之一。他当时正在参加他的第91次滚雷行动，并于攻击河内北边的一座仓库时被高射炮击落。他的354TFS中队的编队已经从200英尺高度投下CBU-2集束炸弹，正当他们拉起脱离之际，卡斯勒的僚机飞行员弗雷德.弗洛姆(Fred Flom)中尉的F-105D 62-4327腹部被37 mm高射炮弹击中。根据长机的建议，他于1000英尺高度550节时速的情况下跳伞，飞机几秒钟后爆炸，而他却在距离河内仅55英里处摔昏过去。
卡斯勒带领着他的小队前去寻找加油机，然后回来执行救援战斗空中巡逻(RESCAP)任务，但是弗洛姆已经被俘。就在坠机地点上空盘旋的时候，他的F-105D 62-4343两次被57 mm高射炮弹击中，座舱里浓烟密布。飞机上未经改装的液压系统失灵，他只能弹射跳伞，可是左膝上的控制杆被锁死了，座椅弹射的时候，他的右膝被推向座舱护栏，造成了大腿粉碎性骨折。这名二战的B-29飞行员和朝鲜战争6架战绩的王牌就这么被俘虏了，并作为战俘度过了6年。
1966至67年冬季，劣的天气笼罩了北越大部分地区，但损失仍在继续，然而，损失率仅为每1000架次1.6架----这表明了F-105部队的工作负荷量之大。10月损失了5架、11月损失了9架、12月损失了7架。其中最沉重的打击就是12月8日，备受尊敬的354TFS中队长唐.阿塞尔(Don Asire)中校被击落阵亡。
355TFW联队被派去轰炸福安附近的铁路和储油设施，但是由于天气原因而取消，因此他们转向次要目标。米格机和地空导弹的警告不断在他们耳机中响起，由杰克.布劳顿中校率领、唐.阿塞尔中校担任3号机的"Kingpin"小队遭到了4架921团米格-21的攻击，这些北越战机在地面管制拦截官(GCI)的引导下从云层下方朝F-105编队接近，然后拉起冲出云层，准备发射导弹。
当F-105D 60-0449“007”准备从呵叻基地起飞时，J75发动机的轰鸣声响彻云霄。这架飞机也被命名为"Bounty Hunter"、"Blue Fox"、"Jose Shilleagh"，于1970年代在弗吉尼亚州空中国民警卫队服役。
看到次要目标也被云层遮挡，布劳顿命令前方的两支F-105小队抛弃炸弹，打开加力转向米格机。他自己的编队此时正在北越米格机后面，因此，米格机飞行员决定停止高速追击，以免成为后方"Kingpin"小队的猎物。然而，一架灰色的米格-21[据说是由苏联教官弗拉基米尔.谢巴科夫(Vladimir Shchbakov)上尉驾驶]从"Kingpin"小队上方冲下，追击阿塞尔中校和他的的僚机哈尔.宾伽曼(Hal Bingaman)。他们已经在云层下方把速度增加至600节，且位于"Kingpin 1"和"2"下方几千英尺处。很快，一阵报警器的尖叫声宣布了阿塞尔座机的毁灭，他的飞机也许被AA-2导弹或者高射炮在超音速逃跑的过程中被击落。
整个滚雷行动期间，约翰逊政府从华盛顿特区对F-105部队的任务规划和目标定位进行了微观管理，但一些战术决策是在当地做出的。1966年12月，乌汶皇家泰国空军基地的战术会议提议压缩两支攻击小队之间的标准五分钟时间间隔，以增加防御者的任务难度。然而，这项决议被退回了第7航空队司令部，显然留在了某人的收件箱里。布劳顿回忆道：