撤军
第二阶段撤军于8月15日开始。为了避免战争即将结束时造成不必要的伤亡，他们决定加大对圣战者预定集结地带的轰炸力度，并在车队撤离的同时不断进行打击，切断各反对派武装的联系，防止携带武器的车队前来接近(仅10月份就有一百多次)。“过河”的每一次出击的效果是完全没问题的----分配的任务必须通过从所有地区航空弹药库向阿富汗山区“推出”的库存来定量执行。这些空袭是从高空展开的，因为根据情报数据，到1988年秋天，反对派拥有692枚肩扛式地空导弹，770挺ZGU高射机枪，4050挺DShK重机枪。在参与突袭的苏-17M3和M4上，远程导航无线电系统得到了改进，为自动进入目标和轰炸提供了方便。但是这种打击的准确率很低，1988年夏天，在一次突袭中，阿富汗军团的战地指挥部“被轰炸”。
为了掩护部队从阿富汗撤出，苏联的边境机场集中了一批轰炸机、强击机和歼击轰炸机，其目的是空袭营地、圣战者基地和抵抗武装的活动区。飞行员定期用炸弹在路旁“犁地”，挫败了对撤军车队的攻击，使敌人日夜不停地处于紧张状态。第40集团军司令格罗莫夫中将谈到所选战术的重要性如下：“飞行员和炮兵目前在打击企图使局势恶化且顽固抵抗的武装团体方面发挥着重要作用。为了避免喀布尔遭到火箭弹袭击，我们正在进行轰炸。”
坎大哈机场当年苏军的石碑，已经破败不堪。
除其他部队外，136APIB和156APIB团的苏-17M3以及从远东调来的苏-17M4中队也轰炸北部的目标。这就是远东军区第1航空军佩列亚斯拉夫卡(Pereyaslavka/Переяславка)机场302APIB团第一中队。该中队包括14架单座苏-17M4歼击轰炸机和两架苏-17UM3双座机。转场前，该团的战机进行了重新装备----不再是通常机身下的四个挂架，而是另外加装了2各，以便在飞行途中多挂载一对PTB-800副油箱。由于优先在肩扛式地空导弹无法到达的高空飞行，因此飞机没有配备ASO-2B红外干扰弹发射器和腹侧装甲板(调往战区前已经没有时间对飞机进行改装)。例外的是“34”系列的两架飞机：“50”号机的机身上方装有8个ASO-2V发射器，而“39”号机装有全套12个ASO-2VM发射器和装甲板。中队长是弗拉基米尔.邦达连科(Vladimir Bondarenko/Владимир Бондаренко)中校，航空师的领航员扎里波夫(Zaripov/Зарипов)上校被任命为航空助理。该中队于1988年11月14日抵达科浩罕，在那里驻扎至1989年2月14日，完成了撤军前一晚完成最后一次作战任务。中队的18名飞行员在三个月内飞行了100至120个架次，中队指挥官弗拉基米尔.邦达连科是领头羊----尽管作战行动和组织工作都很繁重，他还是执行了近200架次的任务！远东中队总共出动了2500个架次，而且在仅三个月的战斗里，这样的成就更令人印象深刻。根据不同的安排，中队飞行员人均飞行了55至57架次。因为空袭是从高处进行的，所以该中队的全部飞机都没有受到任何战斗损伤。1989年3月10日，第302APIB团的第一中队回到了它的家乡佩列亚斯拉夫卡。
外高加索313ORAP团的苏-17M3R侦察机，从阿富汗回国后，这架飞机的涂装全部更换，但保留了“21”的编号和各种彩绘。
远东中队的作战飞机以“潘杰希尔之虎”----艾哈迈德.马苏德的名字被挂在每个人的嘴边，然而，事实上，他们并没有前往潘杰希尔峡谷执行任务，因为那里的目标太远了，苏-17M4无法到达。此外，考虑到其起源，将其称为“阿穆尔猛虎”更为恰当(毕竟，艾哈迈德.马苏德的头衔实际上听起来像是“潘杰希尔之狮”，而在阿富汗从未发现过猛虎！)佩列亚斯拉夫卡的苏-17M4发动机进气口的警示标语与传统的飞机不同：在许多飞机上都画有凶猛的牙齿。来自浩罕的苏-17M4的另一个特点是五角星任务标记的涂刷方式----在接下来的10次飞行中，星星被涂上了白色的轮廓，只有在完成10次完整的任务后，才把里面填满白色。但其它单位“优秀飞机”的标兵铭牌却没有被302APIB团采用。
鲍里斯.切特维塔科夫(Boris Chetvertakov/Борис Четвертаков)大尉曾在302APIB团担任高级飞行员，他描述了在浩罕繁重的工作：“他们指定从凌晨03:00发起空袭，以便稍后我们仍有时间进行晨祷。在16架飞机中，我是第四架。每架飞机滑行到跑道的末端，以40秒的时间间隔升空。长机滑行了，我因为电气系统的转换器出了故障，起步有点晚，最后打开电源，跟在长机后面。我推上油门以便赶上他，然后一路滑行。我们的挂载已经是极限重量4枚RBK-500和2枚PTB-800。飞机很重，但是加速了，所以当我意识到还有200米就要转弯时，已经来不及减速了。